Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Gnb1P62874 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Gnb1P62874 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Gnb1P62874 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Gnb1P62874 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Gnb1P62874 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gnb1P62874 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Gnb1P62874 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gnb1P62874 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Gnb1P62874 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gnb1P62874 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gnb1P62874 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Gnb1P62874 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Gnb1P62874 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gnb1P62874 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Gnb1P62874 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Gnb1P62874 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gnb1P62874 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gnb1P62874 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gnb1P62874 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gnb1P62874 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Gnb1P62874 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gnb1P62874 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gnb1P62874 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gnb1P62874 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Gnb1P62874 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
Gnb1P62874 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gnb1P62874 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gnb1P62874 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gnb1P62874 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gnb1P62874 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Gnb1P62874 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Gnb1P62874 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gnb1P62874 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Gnb1P62874 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gnb1P62874 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gnb1P62874 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gnb1P62874 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Gnb1P62874 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Gnb1P62874 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gnb1P62874 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Gnb1P62874 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gnb1P62874 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gnb1P62874 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Gnb1P62874 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gnb1P62874 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gnb1P62874 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gnb1P62874 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gnb1P62874 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gnb1P62874 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Gnb1P62874 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Gnb1P62874 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
Gnb1P62874 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gnb1P62874 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Gnb1P62874 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gnb1P62874 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gnb1P62874 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gnb1P62874 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Gnb1P62874 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gnb1P62874 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Gnb1P62874 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Gnb1P62874 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Gnb1P62874 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Gnb1P62874 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gnb1P62874 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Gnb1P62874 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Gnb1P62874 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Gnb1P62874 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Gnb1P62874 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Gnb1P62874 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Gnb1P62874 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gnb1P62874 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Gnb1P62874 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Gnb1P62874 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Gnb1P62874 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Gnb1P62874 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Gnb1P62874 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Gnb1P62874 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Gnb1P62874 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Gnb1P62874 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Gnb1P62874 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Gnb1P62874 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Gnb1P62874 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Gnb1P62874 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gnb1P62874 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Gnb1P62874 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Gnb1P62874 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gnb1P62874 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gnb1P62874 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gnb1P62874 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms