Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gnb1P62874 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gnb1P62874 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gnb1P62874 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gnb1P62874 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gnb1P62874 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gnb1P62874 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gnb1P62874 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gnb1P62874 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gnb1P62874 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gnb1P62874 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gnb1P62874 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gnb1P62874 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gnb1P62874 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnb1P62874 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gnb1P62874 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnb1P62874 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gnb1P62874 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gnb1P62874 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gnb1P62874 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnb1P62874 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gnb1P62874 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnb1P62874 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnb1P62874 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnb1P62874 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gnb1P62874 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gnb1P62874 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gnb1P62874 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gnb1P62874 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gnb1P62874 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gnb1P62874 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gnb1P62874 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gnb1P62874 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gnb1P62874 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gnb1P62874 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gnb1P62874 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gnb1P62874 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnb1P62874 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnb1P62874 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnb1P62874 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gnb1P62874 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnb1P62874 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnb1P62874 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnb1P62874 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnb1P62874 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnb1P62874 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnb1P62874 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gnb1P62874 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gnb1P62874 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gnb1P62874 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gnb1P62874 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gnb1P62874 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gnb1P62874 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gnb1P62874 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gnb1P62874 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gnb1P62874 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gnb1P62874 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gnb1P62874 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gnb1P62874 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gnb1P62874 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gnb1P62874 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gnb1P62874 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gnb1P62874 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gnb1P62874 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gnb1P62874 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gnb1P62874 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gnb1P62874 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gnb1P62874 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gnb1P62874 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gnb1P62874 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gnb1P62874 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gnb1P62874 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gnb1P62874 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gnb1P62874 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gnb1P62874 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gnb1P62874 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gnb1P62874 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gnb1P62874 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gnb1P62874 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gnb1P62874 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gnb1P62874 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gnb1P62874 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gnb1P62874 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gnb1P62874 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gnb1P62874 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gnb1P62874 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gnb1P62874 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gnb1P62874 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnb1P62874 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gnb1P62874 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms