Protein–RNA interactions for Protein: F7BWT7

Tspan15, Tetraspanin-15, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan15F7BWT7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Tspan15F7BWT7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tspan15F7BWT7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tspan15F7BWT7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tspan15F7BWT7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tspan15F7BWT7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Tspan15F7BWT7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tspan15F7BWT7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tspan15F7BWT7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tspan15F7BWT7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tspan15F7BWT7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tspan15F7BWT7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tspan15F7BWT7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tspan15F7BWT7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan15F7BWT7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan15F7BWT7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tspan15F7BWT7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Tspan15F7BWT7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Tspan15F7BWT7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Tspan15F7BWT7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tspan15F7BWT7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Tspan15F7BWT7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Tspan15F7BWT7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Tspan15F7BWT7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Tspan15F7BWT7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Tspan15F7BWT7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Tspan15F7BWT7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Tspan15F7BWT7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Tspan15F7BWT7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Tspan15F7BWT7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Tspan15F7BWT7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Tspan15F7BWT7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Tspan15F7BWT7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Tspan15F7BWT7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Tspan15F7BWT7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Tspan15F7BWT7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Tspan15F7BWT7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Tspan15F7BWT7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Tspan15F7BWT7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Tspan15F7BWT7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Tspan15F7BWT7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Tspan15F7BWT7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Tspan15F7BWT7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Tspan15F7BWT7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Tspan15F7BWT7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Tspan15F7BWT7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Tspan15F7BWT7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Tspan15F7BWT7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tspan15F7BWT7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Tspan15F7BWT7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tspan15F7BWT7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Tspan15F7BWT7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tspan15F7BWT7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Tspan15F7BWT7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Tspan15F7BWT7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Tspan15F7BWT7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Tspan15F7BWT7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Tspan15F7BWT7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tspan15F7BWT7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tspan15F7BWT7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Tspan15F7BWT7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Tspan15F7BWT7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Tspan15F7BWT7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Tspan15F7BWT7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Tspan15F7BWT7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Tspan15F7BWT7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Tspan15F7BWT7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Tspan15F7BWT7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Tspan15F7BWT7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tspan15F7BWT7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Tspan15F7BWT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tspan15F7BWT7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Tspan15F7BWT7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Tspan15F7BWT7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Tspan15F7BWT7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Tspan15F7BWT7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Tspan15F7BWT7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Tspan15F7BWT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Tspan15F7BWT7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Tspan15F7BWT7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Tspan15F7BWT7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Tspan15F7BWT7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Tspan15F7BWT7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Tspan15F7BWT7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Tspan15F7BWT7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Tspan15F7BWT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Tspan15F7BWT7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,7 ms