RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NischQ80TM9 1593 aa27.06■■□□□ 1.92
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.88■■□□□ 1.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.7■■□□□ 1.54
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ScribQ80U72 1612 aa24.49■■□□□ 1.51
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kdm5dQ62240 1548 aa23.93■■□□□ 1.42
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NacadQ5SWP3 1504 aa23.84■■□□□ 1.41
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.83■■□□□ 1.41
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.63■■□□□ 1.37
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.34■■□□□ 1.33
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Baz1aO88379 1555 aa23.29■■□□□ 1.32
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.99■■□□□ 1.27
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BicraF8VPZ9 1578 aa22.91■■□□□ 1.26
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rtl1Q7M732 1744 aa22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.54■■□□□ 1.2
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CftrP26361 1476 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ercc6F8VPZ5 1481 aa21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HrcG5E8J6 738 aa21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Golga3P55937 1487 aa21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Frmpd1A2AKB4 1549 aa21.69■■□□□ 1.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Chic1Q8CBW7 227 aa21.61■■□□□ 1.05
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.47■■□□□ 1.03
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gab3Q8BSM5 595 aa21.42■■□□□ 1.02
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Top2bQ64511 1612 aa21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il27Q8K3I6 234 aa21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep164Q5DU05 1446 aa21.31■■□□□ 1
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Unc13aQ4KUS2 1712 aa21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam135aQ6NS59 1506 aa21.2■□□□□ 0.98
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Duox2A2AQ99 1517 aa20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa20.39■□□□□ 0.86
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.39■□□□□ 0.85
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clip1Q922J3 1391 aa20.37■□□□□ 0.85
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SynmQ70IV5 1561 aa20.24■□□□□ 0.83
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ift140E9PY46 1464 aa20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eea1Q8BL66 1411 aa20.19■□□□□ 0.82
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Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pla2r1Q62028 1487 aa20.15■□□□□ 0.82
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