Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPV7

9530002B09Rik, AUMP, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530002B09RikQ9EPV7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
9530002B09RikQ9EPV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
9530002B09RikQ9EPV7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
9530002B09RikQ9EPV7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
9530002B09RikQ9EPV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
9530002B09RikQ9EPV7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
9530002B09RikQ9EPV7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
9530002B09RikQ9EPV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
9530002B09RikQ9EPV7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
9530002B09RikQ9EPV7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
9530002B09RikQ9EPV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
9530002B09RikQ9EPV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
9530002B09RikQ9EPV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
9530002B09RikQ9EPV7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
9530002B09RikQ9EPV7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
9530002B09RikQ9EPV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
9530002B09RikQ9EPV7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
9530002B09RikQ9EPV7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
9530002B09RikQ9EPV7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
9530002B09RikQ9EPV7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
9530002B09RikQ9EPV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
9530002B09RikQ9EPV7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
9530002B09RikQ9EPV7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
9530002B09RikQ9EPV7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
9530002B09RikQ9EPV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
9530002B09RikQ9EPV7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
9530002B09RikQ9EPV7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
9530002B09RikQ9EPV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
9530002B09RikQ9EPV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
9530002B09RikQ9EPV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9530002B09RikQ9EPV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
9530002B09RikQ9EPV7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
9530002B09RikQ9EPV7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
9530002B09RikQ9EPV7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
9530002B09RikQ9EPV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9530002B09RikQ9EPV7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
9530002B09RikQ9EPV7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
9530002B09RikQ9EPV7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
9530002B09RikQ9EPV7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
9530002B09RikQ9EPV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
9530002B09RikQ9EPV7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
9530002B09RikQ9EPV7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
9530002B09RikQ9EPV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9530002B09RikQ9EPV7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
9530002B09RikQ9EPV7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
9530002B09RikQ9EPV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
9530002B09RikQ9EPV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9530002B09RikQ9EPV7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
9530002B09RikQ9EPV7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9530002B09RikQ9EPV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9530002B09RikQ9EPV7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9530002B09RikQ9EPV7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9530002B09RikQ9EPV7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
9530002B09RikQ9EPV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
9530002B09RikQ9EPV7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9530002B09RikQ9EPV7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9530002B09RikQ9EPV7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9530002B09RikQ9EPV7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9530002B09RikQ9EPV7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
9530002B09RikQ9EPV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9530002B09RikQ9EPV7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9530002B09RikQ9EPV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
9530002B09RikQ9EPV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
9530002B09RikQ9EPV7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
9530002B09RikQ9EPV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9530002B09RikQ9EPV7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
9530002B09RikQ9EPV7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9530002B09RikQ9EPV7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
9530002B09RikQ9EPV7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
9530002B09RikQ9EPV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9530002B09RikQ9EPV7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
9530002B09RikQ9EPV7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
9530002B09RikQ9EPV7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9530002B09RikQ9EPV7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9530002B09RikQ9EPV7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
9530002B09RikQ9EPV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9530002B09RikQ9EPV7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9530002B09RikQ9EPV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9530002B09RikQ9EPV7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
9530002B09RikQ9EPV7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9530002B09RikQ9EPV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9530002B09RikQ9EPV7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9530002B09RikQ9EPV7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9530002B09RikQ9EPV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9530002B09RikQ9EPV7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
9530002B09RikQ9EPV7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9530002B09RikQ9EPV7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9530002B09RikQ9EPV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
9530002B09RikQ9EPV7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9530002B09RikQ9EPV7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9530002B09RikQ9EPV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9530002B09RikQ9EPV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9530002B09RikQ9EPV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9530002B09RikQ9EPV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms