Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ifna2P01573 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ifna2P01573 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ifna2P01573 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifna2P01573 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifna2P01573 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifna2P01573 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifna2P01573 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifna2P01573 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifna2P01573 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifna2P01573 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifna2P01573 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifna2P01573 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifna2P01573 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifna2P01573 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifna2P01573 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifna2P01573 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifna2P01573 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifna2P01573 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifna2P01573 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifna2P01573 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifna2P01573 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifna2P01573 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifna2P01573 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifna2P01573 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifna2P01573 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifna2P01573 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifna2P01573 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna2P01573 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifna2P01573 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifna2P01573 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifna2P01573 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifna2P01573 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifna2P01573 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifna2P01573 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifna2P01573 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifna2P01573 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifna2P01573 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna2P01573 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna2P01573 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifna2P01573 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifna2P01573 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifna2P01573 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifna2P01573 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifna2P01573 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifna2P01573 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifna2P01573 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifna2P01573 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifna2P01573 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifna2P01573 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifna2P01573 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifna2P01573 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifna2P01573 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifna2P01573 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifna2P01573 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifna2P01573 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifna2P01573 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifna2P01573 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifna2P01573 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna2P01573 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna2P01573 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna2P01573 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifna2P01573 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifna2P01573 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifna2P01573 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifna2P01573 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifna2P01573 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifna2P01573 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifna2P01573 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifna2P01573 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifna2P01573 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifna2P01573 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifna2P01573 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna2P01573 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna2P01573 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna2P01573 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna2P01573 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifna2P01573 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifna2P01573 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifna2P01573 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifna2P01573 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifna2P01573 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifna2P01573 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifna2P01573 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifna2P01573 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifna2P01573 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifna2P01573 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifna2P01573 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna2P01573 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifna2P01573 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifna2P01573 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna2P01573 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifna2P01573 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna2P01573 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms