Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ifna2P01573 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ifna2P01573 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ifna2P01573 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ifna2P01573 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ifna2P01573 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Ifna2P01573 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ifna2P01573 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ifna2P01573 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ifna2P01573 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ifna2P01573 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ifna2P01573 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ifna2P01573 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ifna2P01573 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ifna2P01573 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ifna2P01573 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ifna2P01573 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ifna2P01573 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ifna2P01573 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Ifna2P01573 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ifna2P01573 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ifna2P01573 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ifna2P01573 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Ifna2P01573 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Ifna2P01573 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ifna2P01573 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ifna2P01573 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ifna2P01573 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ifna2P01573 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Ifna2P01573 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ifna2P01573 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Ifna2P01573 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ifna2P01573 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ifna2P01573 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ifna2P01573 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ifna2P01573 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ifna2P01573 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Ifna2P01573 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Ifna2P01573 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Ifna2P01573 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ifna2P01573 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ifna2P01573 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ifna2P01573 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ifna2P01573 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ifna2P01573 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ifna2P01573 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ifna2P01573 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ifna2P01573 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ifna2P01573 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ifna2P01573 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ifna2P01573 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ifna2P01573 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ifna2P01573 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ifna2P01573 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ifna2P01573 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ifna2P01573 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ifna2P01573 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ifna2P01573 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ifna2P01573 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ifna2P01573 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ifna2P01573 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna2P01573 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ifna2P01573 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ifna2P01573 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Ifna2P01573 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ifna2P01573 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ifna2P01573 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna2P01573 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna2P01573 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ifna2P01573 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ifna2P01573 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ifna2P01573 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ifna2P01573 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna2P01573 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna2P01573 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna2P01573 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna2P01573 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,22
Ifna2P01573 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Ifna2P01573 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna2P01573 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Ifna2P01573 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ifna2P01573 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ifna2P01573 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ifna2P01573 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ifna2P01573 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ifna2P01573 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Ifna2P01573 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ifna2P01573 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ifna2P01573 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna2P01573 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna2P01573 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Ifna2P01573 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ifna2P01573 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna2P01573 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms