Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna7P49582 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chrna7P49582 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna7P49582 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna7P49582 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chrna7P49582 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna7P49582 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna7P49582 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna7P49582 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna7P49582 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna7P49582 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna7P49582 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna7P49582 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna7P49582 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna7P49582 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna7P49582 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna7P49582 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna7P49582 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna7P49582 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna7P49582 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna7P49582 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna7P49582 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna7P49582 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna7P49582 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna7P49582 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna7P49582 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna7P49582 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna7P49582 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna7P49582 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna7P49582 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna7P49582 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna7P49582 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna7P49582 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna7P49582 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna7P49582 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna7P49582 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna7P49582 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna7P49582 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna7P49582 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrna7P49582 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna7P49582 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna7P49582 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna7P49582 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna7P49582 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna7P49582 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna7P49582 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna7P49582 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna7P49582 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna7P49582 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna7P49582 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna7P49582 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna7P49582 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna7P49582 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chrna7P49582 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna7P49582 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna7P49582 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna7P49582 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna7P49582 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chrna7P49582 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna7P49582 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna7P49582 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna7P49582 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna7P49582 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna7P49582 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna7P49582 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna7P49582 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna7P49582 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna7P49582 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna7P49582 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna7P49582 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chrna7P49582 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna7P49582 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna7P49582 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna7P49582 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna7P49582 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna7P49582 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna7P49582 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna7P49582 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna7P49582 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna7P49582 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna7P49582 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna7P49582 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna7P49582 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna7P49582 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna7P49582 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna7P49582 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna7P49582 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna7P49582 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna7P49582 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna7P49582 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna7P49582 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna7P49582 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna7P49582 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna7P49582 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms