RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A PRP45P28004 379 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ASK1P35734 292 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RTT107P38850 1070 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ROK1P45818 564 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YNL034WP53963 612 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SPA2P23201 1466 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RPL7AP05737 244 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RAD16P31244 790 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ATO2P32907 282 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A BIT2P38346 545 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YJL049WP47048 450 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HXT16P47185 567 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HOL1P53389 586 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A FMP42Q04991 504 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A BSP1Q06604 576 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CSR1Q06705 408 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SET3P36124 751 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YKR051WP36142 418 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YEN1P40028 759 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A BUD17P53727 317 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ALF1P53904 254 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PFA5Q03289 374 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A IZH1Q03419 316 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RRI1Q12468 440 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SIN3P22579 1536 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A AQY1P0CD91 305 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A EMP70P32802 667 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YJL193WP39542 402 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HEL2Q05580 639 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A DNF1P32660 1571 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PHO5P00635 467 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CPA2P03965 1118 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SRD1P09007 221 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RNR3P21672 869 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PXL1P36166 706 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ORC5P50874 479 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ARG5,6Q01217 863 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YLR281CQ05863 155 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YFT2Q06676 274 aa0.72□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YML002WP0CF17 737 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A REV1P12689 985 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HOS4P40480 1083 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A DUG3P53871 357 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data0.71□□□□□ -2.3not detected
YPL060C-AYPL060C-A CCL1P37366 393 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PDR8Q06149 701 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GEP3Q08622 556 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RTC1Q08281 1341 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RPS17AP02407 136 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RPS17BP14127 136 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SEC18P18759 758 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HOG1P32485 435 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A DSS4P32601 143 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A DED81P38707 554 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GDH3P39708 457 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SIT1P39980 628 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CIR1P42940 261 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A NOP9P47077 666 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A BUL1P48524 976 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TAF4P50105 388 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TFB2Q02939 513 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RDR1Q08904 546 aa0.71□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A IMG2P25642 146 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data0.7□□□□□ -2.3not detected
YPL060C-AYPL060C-A SAW1P39735 261 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A BUD16P39988 312 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A NUP82P40368 713 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SPC105P53148 917 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MCH1Q07376 486 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YRM1Q12340 786 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CSR2Q12734 1121 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YGR161W-CQ3E744 92 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ADR1P07248 1323 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YMC2P38087 329 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SDS24P38314 527 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SAP1P39955 897 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YPR027CQ12079 277 aa0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HRP1Q99383 534 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CDC9P04819 755 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PRP4P20053 465 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ERG6P25087 383 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RPF2P36160 344 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A NMD5P46970 1048 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YCG1Q06680 1035 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HMG1P12683 1054 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A NUP120P35729 1037 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A LHS1P36016 881 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A FHN1P53279 174 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SMA2Q04658 369 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CAN1P04817 590 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MRPL36P36531 177 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A LYS9P38999 446 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A AZF1P41696 914 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YPS7Q06325 596 aa0.69□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YOL159CQ08300 171 aa0.69□□□□□ -2.3
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