RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	CEX1	Q12453	761 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
DDP1	YOR163W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	APM4	Q99186	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MET17	P06106	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MTF2	P10849	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	HSF1	P10961	833 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	YBR225W	P38321	900 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SUL1	P38359	859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	RRF1	P38771	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	PUG1	P40100	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	CIR1	P42940	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MDE1	P47095	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	NIT3	P49954	291 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SSL2	Q00578	843 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MDM38	Q08179	573 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	ADH4	P10127	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	CKA1	P15790	372 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
DDP1	YOR163W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MNE1	P24720	663 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	NPL6	P32832	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	ATG19	P35193	415 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	YKL151C	P36059	337 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	NPR2	P39923	615 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	YER010C	P40011	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	LTP1	P40347	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	PSF2	P40359	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SAP4	P53036	818 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SNO4	Q04902	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	HSP32	Q08992	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DDP1	YOR163W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	ARG3	P05150	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	PMS1	P14242	873 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SGF29	P25554	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YCL002C	P25565	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	ERG3	P32353	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	STE13	P33894	931 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SDS22	P36047	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YKR051W	P36142	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	UBP7	P40453	1071 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SNM1	P40993	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YJL055W	P47044	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	HXT16	P47185	567 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YNR061C	P53747	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SRT1	Q03175	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	NFI1	Q12216	726 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	ISA2	Q12425	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	PHO5	P00635	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	CLB4	P24871	460 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	ERG4	P25340	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	HXT4	P32467	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	MDL1	P33310	695 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	TGL1	P34163	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SET3	P36124	751 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	GIC1	P38785	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	UME6	P39001	836 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SWD1	P39706	426 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	KHA1	P40309	873 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YJL068C	P40363	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	VID28	P40547	921 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	POL31	P46957	487 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	STB4	P50104	949 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	ZDS2	P54786	942 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	SEC5	P89102	971 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	FCP1	Q03254	732 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	CRR1	Q05790	422 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	TFC6	Q06339	672 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	IRC10	Q08118	586 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	REX3	Q12090	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	PSF3	Q12146	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DDP1	YOR163W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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