RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS24P36095 224 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C PSY4P38193 441 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C ESBP6P53918 673 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C HAP5Q02516 242 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR206WQ03695 313 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C HPF1Q05164 967 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C TMA16Q08687 178 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C YRR1Q12172 810 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C AIM44Q99299 758 aa12.9□□□□□ -0.34
tM(CAU)CtM(CAU)C NIP100P33420 868 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C STE13P33894 931 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SPT8P38915 602 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PIK1P39104 1066 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SDS3P40505 327 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PUS2P53167 370 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C NDD1Q08887 554 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SPO21Q12411 609 aa12.89□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C VMA4P22203 233 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SMC1P32908 1225 aa12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SAP190P36123 1033 aa12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C HOP2P53187 214 aa12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C AIM32Q04689 311 aa12.88□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data12.87□□□□□ -0.35not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C HSF1P10961 833 aa12.87□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C MET22P32179 357 aa12.87□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RVS167P39743 482 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C FLC3P53121 802 aa12.87□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RPN4Q03465 531 aa12.87□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS3P05750 240 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C YIH1P25637 258 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C DJP1P40564 432 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C YJR079WP47126 109 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PYK2P52489 506 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C GYL1Q04322 720 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C YCS4Q06156 1176 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C HMI1Q12039 706 aa12.86□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SRB2P34162 210 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C HSL7P38274 827 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C EXO5P38289 585 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C URA8P38627 578 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C NPY1P53164 384 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C THI20Q08224 551 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RSB1Q08417 382 aa12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD3P06839 778 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C SEC6P32844 805 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C BST1P43571 1029 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C RTT101P47050 842 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PRP24P49960 444 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C TAD1P53065 400 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C COP1P53622 1201 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PEX13P80667 386 aa12.84□□□□□ -0.35
tM(CAU)CtM(CAU)C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data12.84□□□□□ -0.35not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C BI2P03873 423 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C BI4P03879 638 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C TUP1P16649 713 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C EXO1P39875 702 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YER189WP40104 122 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YPR078CQ06813 372 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C BI3Q9ZZW7 517 aa12.83□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C KAR3P17119 729 aa12.82□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C CCR4P31384 837 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C RML2P32611 393 aa12.82□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C CRP1P38845 465 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C KTR6P54070 446 aa12.82□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YJU3P28321 313 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C TFB1P32776 642 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C SRX1P36077 127 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C PXL1P36166 706 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YPT35P38815 214 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YAP5P40574 245 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C RSM7P47150 247 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C AIM39Q08223 395 aa12.81□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C MSH3P25336 1018 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C RRN6P32786 894 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C BAT1P38891 393 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C SNZ3P43545 298 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C NUP84P52891 726 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C SNZ2P53824 298 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C INA17Q02888 182 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YLR012CQ07927 99 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C PEX15Q08215 383 aa12.8□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C CYC8P14922 966 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C PUT4P15380 627 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C SEC65P29478 273 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C RPN12P32496 274 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C UTH1P36135 365 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C WSC4P38739 605 aa12.79□□□□□ -0.36
tM(CAU)CtM(CAU)C YJR061WP40355 935 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 132 ms