RNA–Protein interactions for RNA: YOL009C

MDM12, Transcript of Mitochondrial outer membrane protein, ERMES complex subunit, yeast

Gene MDM12, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM12	YOL009C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	BRF1	P29056	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	REV7	P38927	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	BEM4	P39011	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	GET2	P40056	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	YNL195C	P40168	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	TPM2	P40414	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	NDC80	P40460	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	BNA2	P47125	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	NPY1	P53164	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	VTC3	Q02725	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	PDR10	P51533	1564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	VPS15	P22219	1454 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM12	YOL009C	PCT1	P13259	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	MSP1	P28737	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SEC6	P32844	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	PHO11	P35842	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	PHO12	P38693	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	NUP60	P39705	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ARO10	Q06408	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TAF3	Q12297	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	VBA3	P25594	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ADY2	P25613	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	NUF2	P33895	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	KDX1	P36005	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TCD1	P38756	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	IMO32	P53219	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	FHN1	P53279	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ARP4	P80428	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	APC2	Q12440	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	MSM1	P22438	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	BUD6	P41697	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	CAF16	P43569	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	DNM1	P54861	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YML119W	Q03208	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	THI7	Q05998	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	MDM12	Q92328	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	EFM2	P38347	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	NUP82	P40368	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YIL166C	P40445	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	HSP42	Q12329	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ECM3	Q99252	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RAD9	P14737	1309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	LTE1	P07866	1435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SPO14	P36126	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	EXO84	P38261	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	YAP1802	P53309	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RPN4	Q03465	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	USV1	Q12132	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	NKP1	Q12493	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RAD50	P12753	1312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	SAC3	P46674	1301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	CAT8	P39113	1433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RAD18	P10862	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	DMC1	P25453	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM12	YOL009C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms