RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C TUP1P16649 713 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PRE4P30657 266 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C GLG1P36143 616 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C APL3P38065 1025 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CTP1P38152 299 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.1□□□□□ -1.91not detected
RPB11YOL005C YEL076CP39971 216 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C EAF5P39995 279 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C EMP65P40085 556 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C KHA1P40309 873 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PRM2P40534 656 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C HOL1P53389 586 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NSE5Q03718 556 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PEX15Q08215 383 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SEC6P32844 805 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YPT7P32939 208 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C EHT1P38295 451 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TDP1P38319 544 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PPE1P38796 400 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C FTR1P40088 404 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TRS23Q03784 219 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YCG1Q06680 1035 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C IRC10Q08118 586 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MPD2Q99316 277 aa3.09□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C HMG2P12684 1045 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.08□□□□□ -1.92not detected
RPB11YOL005C DMC1P25453 334 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C GMH1P36125 273 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YEL025CP39991 1188 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YNL034WP53963 612 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YNL018CP53976 612 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C MFM1Q02783 413 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C FDC1Q03034 503 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YOR378WQ08902 515 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C NUR1Q12066 484 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C LAM4P38800 1345 aa3.08□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PCK1P10963 549 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C STE12P13574 688 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C KCC4P25389 1037 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C CDS1P38221 457 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C BDH2P39713 417 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PMT6P42934 759 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C IZH3Q07959 543 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C RKI1Q12189 258 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C HOS1Q12214 470 aa3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SEC12P11655 471 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C STL1P39932 569 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YIL092WP40497 633 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C THI6P41835 540 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C IRC5P43610 853 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PEX8P53248 589 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C UFO1Q04511 668 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C NYV1Q12255 253 aa3.06□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SPO11P23179 398 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PHO3P24031 467 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C MTC7P32633 139 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PPZ2P33329 710 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C NIC96P34077 839 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C UBS1P38290 277 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SAW1P39735 261 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YJR008WP47085 338 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C IOC4Q04213 475 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SLX4Q12098 748 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C TAF3Q12297 353 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C VPS5Q92331 675 aa3.05□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C RIM4P38741 713 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C TAH11P47112 604 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YDL183CP48569 320 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YIP4P53093 235 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PEF1P53238 335 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C SNF12P53628 566 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C HLR1Q04429 423 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YOL057WQ08225 711 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C YPL216WQ08964 1102 aa3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPB11YOL005C PSF3Q12146 194 aa3.04□□□□□ -1.92
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