RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W OPT1P40897 799 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CTR1P49573 406 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ERP6P53198 216 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W VPS30Q02948 557 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W AIM39Q08223 395 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SGO1Q08490 590 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W OSH2Q12451 1283 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W AIM44Q99299 758 aa2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W REC104P33323 182 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PET10P36139 283 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CTF8P38877 133 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ALD5P40047 520 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SDP1P40479 209 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SPO75Q07798 868 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YLR422WQ06409 1932 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PRC1P00729 532 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ARE1P25628 610 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YKL097CP34245 136 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
SSQ1YLR369W ALR2P43553 858 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
SSQ1YLR369W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SKY1Q03656 742 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CSI1Q04368 295 aa2.58□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RIF1P29539 1916 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CIT1P00890 479 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W GAL11P19659 1081 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W BET2P20133 325 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W FUB1P25659 250 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SLX1P38324 304 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W HDA1P53973 706 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ERG5P54781 538 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YKR011CQ02209 353 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W EAF1Q06337 982 aa2.57□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MPH2P0CD99 609 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W KIN82P25341 720 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W OAR1P35731 278 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W VID27P40157 782 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
SSQ1YLR369W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PIG1Q06216 648 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W FLC1Q08967 793 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ENV7Q12003 364 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W HBN1Q96VH4 193 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RFA1P22336 621 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SAD1P43589 448 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W OSW7P43611 510 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RPN4Q03465 531 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MFB1Q04922 465 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MMR1Q06324 491 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W OMS1Q06668 471 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YDL144CQ07589 356 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YLR040CQ07988 224 aa2.56□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CIT2P08679 460 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CTF13P35203 478 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W MOH1P38191 138 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W NDT80P38830 627 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RTS1P38903 757 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YFL052WP43551 465 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YLR455WQ06188 304 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W SUE1Q06524 206 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W RAD61Q99359 647 aa2.55□□□□□ -2
SSQ1YLR369W ERG4P25340 473 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PPG1P32838 368 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W EMC3P36039 253 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W APN2P38207 520 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W GGA2P38817 585 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W IRC8P47046 822 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W PEX19Q07418 342 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YOL073CQ08232 322 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W YPR071WQ12346 211 aa2.54□□□□□ -2
SSQ1YLR369W CHO2P05374 869 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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