RNA–Protein interactions for RNA: YJR048W

CYC1, Transcript of Cytochrome c, isoform 1, yeast

Gene CYC1, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYC1	YJR048W	PHO3	P24031	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	PER1	P25625	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	TRM2	P33753	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	SDS22	P36047	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	UGA2	P38067	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	NPR3	P38742	1146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	SAP4	P53036	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	CBK1	P53894	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	NUC1	P08466	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	HCM1	P25364	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	CNS1	P33313	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YBR225W	P38321	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YLF2	P38746	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	DUN1	P39009	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YER010C	P40011	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YJL068C	P40363	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YIL092W	P40497	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	IMA5	P40884	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	NIT3	P49954	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	VPS62	P53285	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
CYC1	YJR048W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	MSC2	Q03455	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	ENV7	Q12003	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	PUS9	Q12069	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
CYC1	YJR048W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CYC1	YJR048W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	REC107	P21651	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MIH1	P23748	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	EMC1	P25574	760 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ERG3	P32353	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	IME2	P32581	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MDL1	P33310	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PNT1	P38969	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	UBP7	P40453	1071 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
CYC1	YJR048W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CIK1	Q01649	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YAP6	Q03935	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YLH47	Q06493	454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ACM1	Q08981	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	REX3	Q12090	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	DCS2	Q12123	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PSF3	Q12146	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ISA2	Q12425	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ATP12	P22135	325 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	STE11	P23561	717 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	NPP1	P25353	742 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SGF29	P25554	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SEC65	P29478	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	FAT1	P38225	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	FTH1	P38310	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	NPR2	P39923	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PCL7	P40186	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	KHA1	P40309	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	POL31	P46957	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MAD3	P47074	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PHO23	P50947	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ZDS2	P54786	942 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SEC5	P89102	971 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SSL2	Q00578	843 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	PEX25	Q02969	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HOT1	Q03213	719 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	RMT2	Q03305	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TFC6	Q06339	672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	APC5	Q08683	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	HMI1	Q12039	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	CHD1	P32657	1468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	SAC3	P46674	1301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	ARG3	P05150	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MET17	P06106	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYC1	YJR048W	MNE1	P24720	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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