RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	BCK2	P33306	851 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GCS1	P35197	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RTS1	P38903	757 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	BEM4	P39011	633 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YAR028W	P39548	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YER158C	P40095	573 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	FMP10	P40098	244 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MEC3	Q02574	474 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	TGL5	Q12043	749 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ZRT2	Q12436	422 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PIK1	P39104	1066 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PRM2	P40534	656 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YFL054C	P43549	646 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YFL052W	P43551	465 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YSA1	Q01976	231 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SPP1	Q03012	353 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YLL058W	Q12198	575 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NCR1	Q12200	1170 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GRX6	Q12438	231 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SAP30	P38429	201 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GIC1	P38785	314 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	VTC4	P47075	721 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MTC3	P53077	123 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	CRR1	Q05790	422 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YLR407W	Q06070	228 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.22	□□□□□ -1.41	not detected
ATG7	YHR171W	MLH2	Q07980	695 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	NSI1	Q12457	570 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SKS1	Q12505	502 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	AMS1	P22855	1083 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SWC3	P31376	625 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SMI1	P32566	505 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	UGA2	P38067	497 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GPB2	P39717	880 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	YJR061W	P40355	935 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MNT2	P53059	558 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	SHE10	P53075	577 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	DSD1	P53095	428 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	RSF1	Q05043	376 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATG7	YHR171W	MGM1	P32266	881 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	TAF5	P38129	798 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SIF2	P38262	535 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	NUP85	P46673	744 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	ALT1	P52893	592 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YNR068C	P53754	272 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YNR071C	P53757	342 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	CTI6	Q08923	506 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	APL4	Q12028	832 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SKM1	Q12469	655 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	TPK1	P06244	397 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	STB6	P36085	766 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	NEO1	P40527	1151 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	GCV1	P48015	400 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SFB2	P53953	876 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	NGL3	Q03210	505 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	GYL1	Q04322	720 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	PET123	P17558	318 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	DGR2	P32330	852 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YHR131C	P38835	850 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	PSD1	P39006	500 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	THI6	P41835	540 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	IMA1	P53051	589 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	TOF1	P53840	1238 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	SRT1	Q03175	343 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	PHO92	Q06390	306 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	YPR172W	Q06608	200 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	RIT1	P23796	513 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	CLB1	P24868	471 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	MAC1	P35192	417 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	MRPL36	P36531	177 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ATG7	YHR171W	MRPL16	P38064	232 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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