RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C SGF73P53165 657 aa7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C AIM32Q04689 311 aa7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YDL073WQ07454 984 aa7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C AVO1Q08236 1176 aa7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C PCD1Q12524 340 aa7.01□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SEC53P07283 254 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C THR1P17423 357 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RFA1P22336 621 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C DLD1P32891 587 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RIB7P33312 244 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C CTF13P35203 478 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SAP190P36123 1033 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C UIP5P36137 443 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YJR061WP40355 935 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SIP4P46954 829 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C FOL2P51601 243 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YGR045CP53229 120 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ARP4P80428 489 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SRT1Q03175 343 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ARP9Q05123 467 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YLR407WQ06070 228 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C HUA2Q12134 243 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C FRE6Q12473 712 aa7□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MF(ALPHA)2P32435 120 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C TFB1P32776 642 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C DEF1P35732 738 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C LEM3P42838 414 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YJL055WP47044 245 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ENP2P48234 707 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MRX6P48564 524 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MTC3P53077 123 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SFB2P53953 876 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RAD33Q04231 177 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YPR196WQ06595 470 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SWA2Q06677 668 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C CIR2Q08822 631 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data6.99□□□□□ -1.29not detected
SHO1YER118C MET32Q12041 191 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C DIN7Q12086 430 aa6.99□□□□□ -1.29
SHO1YER118C OCA4P25366 362 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data6.98□□□□□ -1.29not detected
SHO1YER118C FLR1P38124 548 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RFC1P38630 861 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SKP2P42843 763 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YFL054CP43549 646 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ARC1P46672 376 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ALT1P52893 592 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C IMA1P53051 589 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MNT2P53059 558 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ART5P53244 586 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C BRE5P53741 515 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YSA1Q01976 231 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C OAZ1Q02803 292 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YPL107WQ02873 248 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RNH1Q04740 348 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C TRI1Q05024 226 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C MLH2Q07980 695 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C APL4Q12028 832 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C TGL5Q12043 749 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa6.98□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ADE3P07245 946 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C APN1P22936 367 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C RIT1P23796 513 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SED4P25365 1065 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SMI1P32566 505 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C FRD1P32614 470 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C GCS1P35197 352 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YNR071CP53757 342 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C EOS1P53938 366 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C GYL1Q04322 720 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C ERB1Q04660 807 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data6.97□□□□□ -1.29not detected
SHO1YER118C RSB1Q08417 382 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C APC5Q08683 685 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C CTI6Q08923 506 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C THI21Q08975 551 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C GET3Q12154 354 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C NBP2Q12163 236 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C SKS1Q12505 502 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C YOR111WQ99210 232 aa6.97□□□□□ -1.29
SHO1YER118C PRC1P00729 532 aa6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C SUI3P09064 285 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C MGM1P32266 881 aa6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C RMA1P36001 430 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C MSC7P38694 644 aa6.96□□□□□ -1.3
SHO1YER118C RTS1P38903 757 aa6.96□□□□□ -1.3
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