RNA–Protein interactions for RNA: YPR017C

DSS4, Transcript of Guanine nucleotide dissociation stimulator for Sec4p, yeast

Gene DSS4, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS4	YPR017C	NDT80	P38830	627 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
DSS4	YPR017C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	VAC8	P39968	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TAF1	P46677	1066 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	LIF1	P53150	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RET3	P53600	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HST1	P53685	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	CSM3	Q04659	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	DUS4	Q06063	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	OPI10	Q08202	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ICL2	Q12031	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	DCS2	Q12123	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TIP41	Q12199	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TAO3	P40468	2376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PRI2	P20457	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RDS1	P25611	832 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RGT1	P32862	1170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SHP1	P34223	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TAT2	P38967	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	BDH2	P39713	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HFM1	P51979	1187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MFM1	Q02783	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	AIM33	Q04516	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PEX19	Q07418	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MET7	Q08645	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ALG1	P16661	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	GSY1	P23337	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MAL33	P38157	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	POA1	P38218	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	GAA1	P39012	614 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	YGR153W	P48238	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TPO2	P53283	614 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RTC4	P53850	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ESC2	Q06340	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MDM38	Q08179	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	IME2	P32581	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MBP1	P39678	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PSF2	P40359	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HUL5	P53119	910 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SLD5	Q03406	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SHE9	Q04172	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	COG8	Q04632	607 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	YLH47	Q06493	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ERP3	Q12403	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MBR1	P23493	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	CDC20	P26309	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	FUN30	P31380	1131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TIM23	P32897	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TFC4	P33339	1025 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MRP8	P35719	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	VBA5	P36172	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	REG2	P38232	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	YAP1801	P38856	637 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	DJP1	P40564	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	MND2	P40577	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	GCV2	P49095	1034 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	CTR1	P49573	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ORC4	P54791	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	PHM6	Q05637	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	ARP6	Q12509	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	AIM44	Q99299	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSS4	YPR017C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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