RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C SPC105P53148 917 aa3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C RIA1P53893 1110 aa3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C SSL2Q00578 843 aa3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C HFI1Q12060 488 aa3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C POM34Q12445 299 aa3.17□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C KAR1P11927 433 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C DGR2P32330 852 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C BCS1P32839 456 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C SER1P33330 395 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C MOH1P38191 138 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C YBR071WP38243 211 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C YHR033WP38690 423 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C PXA1P41909 870 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C BIT61P47041 543 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C SLI1P53304 468 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C THI22Q06490 572 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C USV1Q12132 391 aa3.16□□□□□ -1.9
RPB11YOL005C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C OAR1P35731 278 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C COS111P38308 924 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C BIT2P38346 545 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C BUD8P41698 603 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C RFX1P48743 811 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PEX14P53112 341 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YAP1802P53309 568 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SKY1Q03656 742 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C STP4Q07351 490 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MLH3Q12083 715 aa3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CDC43P18898 376 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C COX11P19516 300 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ATP12P22135 325 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C KIN3P22209 435 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TOM20P35180 183 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NDC80P40460 691 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NIT2P47016 307 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TAF4P50105 388 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C GND2P53319 492 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C COG6P53959 839 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PPN1Q04119 674 aa3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
RPB11YOL005C THR1P17423 357 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C IME1P21190 360 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MRC1P25588 1096 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NTH1P32356 751 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C IES1P43579 692 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MPS3P47069 682 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CTR1P49573 406 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SLD3P53135 668 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C FHN1P53279 174 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YFT2Q06676 274 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YDL086WQ07505 273 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C APM4Q99186 491 aa3.13□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SIR3P06701 978 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ABF1P14164 731 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CDC26P14724 124 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PRP28P23394 588 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PLC1P32383 869 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C HXT4P32467 576 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C GRX7P38068 203 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PAF1P38351 445 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YJL206CP39529 758 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ARG2P40360 574 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SDS3P40505 327 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C NMA2P53204 395 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YGR151CP53287 111 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SPO1P53541 631 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ATG4P53867 494 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TIM50Q02776 476 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TMN2Q04562 672 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C PHM6Q05637 104 aa3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C FUB1P25659 250 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MTH1P35198 433 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ELF1P36053 145 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SET3P36124 751 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C TMN3P40071 706 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C STU2P46675 888 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C MDR1P53258 950 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C DIP5P53388 608 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SPC98P53540 846 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C SND1Q04007 877 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C AIM41Q12032 185 aa3.11□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YEL076C-AP0CX16 216 aa3.1□□□□□ -1.91
RPB11YOL005C YLR464WP0CX17 216 aa3.1□□□□□ -1.91
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