RNA–Protein interactions for RNA: YMR131C

RRB1, Transcript of Nuclear protein involved in early steps of ribosome biogenesis, yeast

Gene RRB1, Length 1,536 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRB1	YMR131C	EAF5	P39995	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	SDS3	P40505	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RRB1	YMR131C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	DON1	Q05610	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	RSC2	Q06488	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	SLX4	Q12098	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	RRN6	P32786	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	BLI1	P35727	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	MRX3	P38172	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	HIS2	P38635	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	GPB2	P39717	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	RAD26	P40352	1085 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	LCB2	P40970	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	ATG36	P46983	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	BTN2	P53286	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	RTT102	P53330	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	ESBP6	P53918	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	ARK1	P53974	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RRB1	YMR131C	MRS2	Q01926	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	VTI1	Q04338	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	AIM41	Q12032	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	TSC13	Q99190	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRB1	YMR131C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	KIP1	P28742	1111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DBF4	P32325	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	EUG1	P32474	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	COT1	P32798	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SEC8	P32855	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TVP38	P36164	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	EXO5	P38289	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SAK1	P38990	1142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CTR1	P49573	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TAM41	P53230	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MDR1	P53258	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NCE103	P53615	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	VTC3	Q02725	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ECI1	Q05871	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ERP3	Q12403	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ECM29	P38737	1868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YLR462W	O13556	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SPO16	P17122	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RRB1	YMR131C	SWI3	P32591	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RPC37	P36121	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	FLR1	P38124	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RRT2	P38332	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RCK2	P38623	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YHL049C	P38722	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TDA3	P38758	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YEL075C	P39972	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NPP2	P39997	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YER189W	P40104	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	LEM3	P42838	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YFL064C	P43540	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NET1	P47035	1189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ACF4	P47129	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	BRO1	P48582	844 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CUL3	P53202	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GYL1	Q04322	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	STE23	Q06010	1027 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GIC2	Q06648	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SHS1	Q07657	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SIL1	Q08199	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ERG11	P10614	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PKC1	P24583	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GYP6	P32806	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TFC4	P33339	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SQT1	P35184	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CCL1	P37366	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	VID24	P38263	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RGD1	P38339	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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