RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	HIR1	P32479	840 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	MMM1	P41800	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YFL054C	P43549	646 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YGL176C	P46945	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YGR237C	P50089	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	DIP5	P53388	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YLH47	Q06493	454 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	TLG2	Q08144	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	ARP6	Q12509	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	COQ2	P32378	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	UTR4	P32626	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	UBP11	P36026	717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	MNN4	P36044	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	PIH1	P38768	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YEL076C	P39971	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	THI6	P41835	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	CBK1	P53894	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	PGA2	P53903	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	ENT2	Q05785	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SPO21	Q12411	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	MRC1	P25588	1096 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YSC84	P32793	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	YET1	P35723	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	PPS1	P38148	807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	MBP1	P39678	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	HNT2	P49775	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	LIF1	P53150	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	PEX8	P53248	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	MFM1	Q02783	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SHE9	Q04172	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SPH1	Q06160	661 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	NKP1	Q12493	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NMD3	YHR170W	TRP3	P00937	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	CHS2	P14180	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SAM35	P14693	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	PER1	P25625	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	RPC25	P35718	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	MCD4	P36051	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	YBR184W	P38299	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SIP3	P38717	1229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	VTC2	P43585	828 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	DAS1	P47005	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	GNT1	Q12096	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SLX4	Q12098	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	FOB1	O13329	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SNF5	P18480	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	SEC65	P29478	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	YKL107W	P34251	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	KAE1	P36132	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	RTT107	P38850	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	PEX7	P39108	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	VAB2	P40003	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	MXR1	P40029	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	YGR130C	P53278	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	CLN3	P13365	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	CKA2	P19454	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NMD3	YHR170W	DPB3	P27344	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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