RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	TDA10	P42938	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ATH1	P48016	1211 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ISM1	P48526	1002 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MRPL50	P53724	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	HER2	Q03557	464 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	RNH1	Q04740	348 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GLO2	Q05584	274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YCS4	Q06156	1176 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PIG1	Q06216	648 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	EAF1	Q06337	982 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	UBX5	Q06682	500 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	NCR1	Q12200	1170 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	RAP1	P11938	827 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ALG1	P16661	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	BAS1	P22035	811 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PEP3	P27801	918 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ZIP1	P31111	875 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SRB4	P32569	687 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	AST1	P35183	429 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	DSS1	P39112	969 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SWP82	P43554	623 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	TIM54	P47045	478 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YJL049W	P47048	450 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	TOF1	P53840	1238 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GCN5	Q03330	439 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GPI17	Q04080	534 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MLC2	Q06580	163 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ADY3	Q07732	790 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GAS4	Q08271	471 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SLM3	Q12093	417 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	BAG7	Q12128	409 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	NCA2	Q12374	616 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	EMP46	Q12396	444 aa		3.76	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YBL010C	P32788	280 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	LRG1	P35688	1017 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	UBP11	P36026	717 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MXR1	P40029	184 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	FMP33	P46998	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	NGL3	Q03210	505 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SIL1	Q08199	421 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	KSS1	P14681	368 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
XRS2	YDR369C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ACH1	P32316	526 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	BCH2	P36122	765 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YHR112C	P38716	378 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MTG2	P38860	518 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	DDI1	P40087	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	JEM1	P40358	645 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MDE1	P47095	244 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GOR1	P53839	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SHE9	Q04172	456 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ARP9	Q05123	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	VPS54	Q12071	889 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	RUP1	Q12242	671 aa		3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	AI2	P03876	854 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SPS22	P25380	463 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	TOM20	P35180	183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MYO3	P36006	1272 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MTW1	P39731	289 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	FMP10	P40098	244 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ALG5	P40350	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MAL11	P53048	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ZIP2	P53061	704 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	VAC7	P53950	1165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ERG5	P54781	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	UBP2	Q01476	1272 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	SGT1	Q08446	395 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	DAS2	Q12084	232 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MNL2	Q12205	849 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	ATP6	P00854	259 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	YAK1	P14680	807 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	DIT1	P21623	536 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	MRPL8	P22353	238 aa		3.74	□□□□□ -1.81
XRS2	YDR369C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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