RNA–Protein interactions for RNA: YDL069C

CBS1, Mitochondrial translational activator of the COB mRNA, yeast

Gene CBS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBS1	YDL069C	UFO1	Q04511	668 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	PXL1	P36166	706 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	TUP1	P16649	713 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	NTH1	P32356	751 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	MTC2	P34246	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	NMD5	P46970	1048 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	PCL10	P53124	433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	CPR8	P53728	308 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	ARP4	P80428	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	CAN1	P04817	590 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	ELF1	P36053	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	GCS1	P35197	352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	ASK1	P35734	292 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	YKR018C	P36114	725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	PCI8	P40512	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	MIH1	P23748	554 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	MRPL9	P31334	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	MNT3	P40549	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	TRS23	Q03784	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	TAF7	Q05021	590 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	COS111	P38308	924 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	SPC97	P38863	823 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	SNO3	P43544	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	RSC9	Q03124	581 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	YFT2	Q06676	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	TSR4	P25040	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	APN2	P38207	520 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	POM34	Q12445	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CBS1	YDL069C	PMA2	P19657	947 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	RIM4	P38741	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	JHD1	P40034	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	IZH3	Q07959	543 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	SEC15	P22224	910 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	HSL7	P38274	827 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	ATG36	P46983	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	HUL5	P53119	910 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	NUP53	Q03790	475 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	GAL11	P19659	1081 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	CAF16	P43569	289 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	NHX1	Q04121	633 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	GDH3	P39708	457 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	YJL043W	P47053	257 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CBS1	YDL069C	CDC9	P04819	755 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	CIT2	P08679	460 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	RPC34	P32910	317 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	BST1	P43571	1029 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	BIT61	P47041	543 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	HER1	Q12276	1246 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	CRC1	Q12289	327 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	KIN82	P25341	720 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YPT7	P32939	208 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	MNN4	P36044	1178 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	APD1	P38281	316 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	PIH1	P38768	344 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YAT2	P40017	923 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	THI6	P41835	540 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	MAL11	P53048	616 aa		4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YPR089W	O13585	888 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YHR202W	P38887	602 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	HOG1	P32485	435 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YIP4	P53093	235 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	VHS3	Q08438	674 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	NDD1	Q08887	554 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CBS1	YDL069C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CBS1	YDL069C	OPT1	P40897	799 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CBS1	YDL069C	YNL018C	P53976	612 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CBS1	YDL069C	BSP1	Q06604	576 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CBS1	YDL069C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CBS1	YDL069C	PET127	P32606	800 aa		3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms