RNA–Protein interactions for RNA: RDN5-4

RDN5-4, Transcript of Variant 5S ribosomal rRNA (5S rRNA) gene, yeast

Gene RDN5-4, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDN5-4	RDN5-4	CLB4	P24871	460 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SIN4	P32259	974 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YMC2	P38087	329 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	REG2	P38232	338 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ERP5	P38819	212 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SNZ3	P43545	298 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YJL045W	P47052	634 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RTA1	P53047	317 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ERP6	P53198	216 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SNZ2	P53824	298 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	HOT1	Q03213	719 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ADI1	Q03677	179 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	HFD1	Q04458	532 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ERP3	Q12403	225 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	AVL9	Q12500	764 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	MOT1	P32333	1867 aa		7	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	IMA3	P0CW40	589 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	IMA4	P0CW41	589 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	KEX2	P13134	814 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SLY1	P22213	666 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RRT12	P25381	491 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	GYP6	P32806	458 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	TFC3	P34111	1160 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	MMS4	P38257	691 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SWC5	P38326	303 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SMF2	P38778	549 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ALG5	P40350	334 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PRK1	P40494	810 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RSM26	P47141	266 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	UBP2	Q01476	1272 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	TRS130	Q03660	1102 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	FMN1	Q03778	218 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	IMA2	Q08295	589 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YLR053C	Q12026	108 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	AIM7	Q12156	149 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SPE4	Q12455	300 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PCD1	Q12524	340 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PUT4	P15380	627 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	EXO70	P19658	623 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	REC107	P21651	314 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	HEM3	P28789	327 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	IRE1	P32361	1115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	MRP4	P32902	394 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.98	□□□□□ -1.29	not detected
RDN5-4	RDN5-4	VPS29	P38759	282 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SCC4	P40090	624 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	KHA1	P40309	873 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	JJJ3	P47138	172 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PCL10	P53124	433 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RCF2	P53721	224 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YDR090C	Q03193	310 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	HFI1	Q12060	488 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YLR278C	Q05854	1341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	GAL10	P04397	699 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	BCS1	P32839	456 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ETR1	P38071	380 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	VID24	P38263	362 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ERP2	P39704	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	JEM1	P40358	645 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YJL107C	P42947	387 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	NET1	P47035	1189 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	MIG2	P53035	382 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YNL058C	P53947	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	GPI13	Q07830	1017 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	OCA6	Q12454	224 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RDN5-4	RDN5-4	ASP3-2	P0CX77	362 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	ASP3-3	P0CX78	362 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	ASP3-4	P0CX79	362 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	PKC1	P24583	1151 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	AAD3	P25612	363 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	YME2	P32843	850 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	SEC6	P32844	805 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RDN5-4	RDN5-4	AVT3	P36062	692 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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