RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B DSE4P53753 1117 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SNO2P53823 222 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B PGA2P53903 129 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B ARK1P53974 638 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YNL011CP53980 444 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B GCR2Q01722 534 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B RSM10Q03201 203 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR444WQ04093 687 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B RSB1Q08417 382 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B GPM2Q12008 311 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B TAF10Q12030 206 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR061WQ12298 539 aa3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B LPX1Q12405 387 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B AIR2Q12476 344 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B TCP1P12612 559 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC63P14906 663 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B CWP1P28319 239 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SEF1P34228 1148 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B PIM1P36775 1133 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B ATG12P38316 186 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B DUN1P39009 513 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B MGS1P40151 587 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SER33P40510 469 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B NPA3P47122 385 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B RSM7P47150 247 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YOL036WQ08206 761 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SAM4Q08985 325 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B GLE1Q12315 538 aa3.54□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.53□□□□□ -1.84not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B YJU3P28321 313 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B SAS3P34218 831 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR054CP38780 354 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR078WP38799 552 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B AKR1P39010 764 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B DSN1P40568 576 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B FLC3P53121 802 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B YPL014WQ02606 381 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B VTC3Q02725 835 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B ELP4Q02884 456 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B CSM3Q04659 317 aa3.53□□□□□ -1.84
tC(GCA)BtC(GCA)B NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B MET4P32389 672 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PIH1P38768 344 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ATG32P40458 529 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PCI8P40512 444 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.52□□□□□ -1.85not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B BIR1P47134 954 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B THI73Q07904 523 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B TMS1Q12116 473 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B SKM1Q12469 655 aa3.52□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ASP3-2P0CX77 362 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ASP3-3P0CX78 362 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ASP3-4P0CX79 362 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ASP3-1P0CZ17 362 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ARF2P19146 181 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PAT1P25644 796 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CIN8P27895 1000 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B MRPL40P36534 297 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B UBP7P40453 1071 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CFD1P40558 293 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B YLH47Q06493 454 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B FMP45Q07651 309 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B RTT10Q08924 1013 aa3.51□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC16P09798 840 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ABF1P14164 731 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B XRS2P33301 854 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B UFE1P41834 346 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ALR2P43553 858 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B IKS1P47042 667 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PMT3P47190 753 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B YGL138CP53122 345 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B RIM20Q12033 661 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B Q0182Q9ZZW1 134 aa3.5□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC9P04819 755 aa3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B LDB16P25587 256 aa3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B DSS4P32601 143 aa3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B TTI1P36097 1038 aa3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
tC(GCA)BtC(GCA)B FHL1P39521 936 aa3.49□□□□□ -1.85
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