RNA–Protein interactions for RNA: YKL143W

LTV1, Transcript of Component of the GSE complex, yeast

Gene LTV1, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LTV1	YKL143W	LCD1	Q04377	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	SGD1	Q06132	899 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	XYL2	Q07993	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PCL8	Q08966	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	OSW2	Q12202	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	AIM44	Q99299	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PPG1	P32838	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	DOM34	P33309	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YPT53	P36019	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PET10	P36139	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	TOK1	P40310	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	CYB2	P00175	591 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	FBP1	P09201	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PHO8	P11491	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	FUN30	P31380	1131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	ERG7	P38604	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YAP1801	P38856	637 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YER158C	P40095	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	NET1	P47035	1189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	SPT20	P50875	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PIP2	P52960	996 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PIB2	P53191	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	ENV11	P53246	860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	SFB2	P53953	876 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	NCB2	Q92317	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	CMP2	P14747	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	OCT1	P35999	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	REC104	P33323	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	MLC1	P53141	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	ALG12	P53730	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	MSC2	Q03455	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
LTV1	YKL143W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LTV1	YKL143W	PDR18	P53756	1333 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	SRM1	P21827	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	TRM2	P33753	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	GAL10	P04397	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	COQ1	P18900	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PRE8	P23639	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	THI4	P32318	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PAH1	P32567	862 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MCD4	P36051	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	CST26	P38226	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PSF2	P40359	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	LYS14	P40971	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	IRC8	P47046	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	YKE2	P52553	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MRPS35	P53292	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PUS9	Q12069	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	LAM4	P38800	1345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	RPC82	P32349	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MAL31	P38156	614 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	LAM1	P38851	1228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MEF2	P39677	819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	GDH3	P39708	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	VAB2	P40003	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	ROT1	Q03691	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	YML037C	Q03703	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
LTV1	YKL143W	ENA1	P13587	1091 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	CHS3	P29465	1165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	SRP101	P32916	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	VID27	P40157	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	ALG2	P43636	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	MAL11	P53048	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	GCN5	Q03330	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LTV1	YKL143W	PLB2	Q03674	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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