RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	MSC2	Q03455	724 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PSR1	Q07800	427 aa		4.32	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	CYB2	P00175	591 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	CDC9	P04819	755 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PPH3	P32345	308 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	BEM3	P32873	1128 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	NIT2	P47016	307 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	IML2	P47031	731 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	GCV2	P49095	1034 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	GTR1	Q00582	310 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	ERO1	Q03103	563 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PHM6	Q05637	104 aa		4.31	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	SRD1	P09007	221 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	MSM1	P22438	575 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	ACA1	P39970	489 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YGL176C	P46945	554 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	NPY1	P53164	384 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	HOL1	P53389	586 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	MEP3	P53390	489 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.3	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.29	□□□□□ -1.72	not detected
DDP1	YOR163W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	SFL1	P20134	766 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	ACE2	P21192	770 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PCL2	P25693	308 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	MLS1	P30952	554 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	NUP120	P35729	1037 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	RRN3	P36070	627 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	RKM3	P38222	552 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PLB1	P39105	664 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	VPS8	P39702	1274 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	MEP1	P40260	492 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	CNN1	P43618	361 aa		4.29	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	MSS18	P08593	268 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PHO81	P17442	1178 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	IMP2'	P32351	346 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	ANP1	P32629	500 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
DDP1	YOR163W	YKL107W	P34251	309 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDP1	YOR163W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SAN1	P22470	610 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	BRF1	P29056	596 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SPC29	P33419	253 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	CKB2	P38930	258 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	MND2	P40577	368 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	ALG2	P43636	503 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	GPI8	P49018	411 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	YGR016W	P53209	190 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	OPY2	Q06810	360 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	GUD1	Q07729	489 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	ADY3	Q07732	790 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	TPO1	Q07824	586 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	RKM4	Q12504	494 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	RMP1	Q12530	201 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	HIR3	P47171	1648 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SPT7	P35177	1332 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	PEX5	P35056	612 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	OAR1	P35731	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	MCM7	P38132	845 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	RXT2	P38255	430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	BIT2	P38346	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	RRT14	P40470	206 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	MPH1	P40562	993 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	QRI7	P43122	407 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	MET12	P46151	657 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	RCF1	Q03713	159 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	HIM1	Q06674	414 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	SDH5	Q08230	162 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	PXA2	P34230	853 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	YKL050C	P35736	922 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DDP1	YOR163W	PET10	P36139	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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