RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	BEM4	P39011	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	EAF5	P39995	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HOS4	P40480	1083 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	TEP1	P53916	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GTR1	Q00582	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	AI3	P03877	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SRP101	P32916	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YIL092W	P40497	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	VID28	P40547	921 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	CDA1	Q06702	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NUR1	Q12066	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	FBP1	P09201	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RSC6	P25632	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	POA1	P38218	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RFC5	P38251	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MNT3	P40549	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MMM1	P41800	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HOL1	P53389	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HXT4	P32467	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PEX7	P39108	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	IRC5	P43610	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	IML2	P47031	731 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PUS2	P53167	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	DPH6	Q12429	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PHO3	P24031	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MSC2	Q03455	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PHM7	Q12252	991 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	ARP7	Q12406	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MSH1	P25846	959 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	APL1	P27351	700 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	CIT3	P43635	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	BFA1	P47113	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MEP3	P53390	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HSF1	P10961	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	AIM26	P32858	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SPC72	P39723	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	IES1	P43579	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YGR012W	P53206	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	BLS1	Q06071	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	OPY2	Q06810	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GPR1	Q12361	961 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RTP1	Q12751	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	CHS3	P29465	1165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	NFU1	P32860	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	PSY4	P38193	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	YHR202W	P38887	602 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	SAW1	P39735	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	STL1	P39932	569 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	YNR014W	P53719	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	RCM1	P53972	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	CMP2	P14747	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	YKR075C	P36155	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	AKR1	P39010	764 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	MAD3	P47074	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	ASM4	Q05166	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	TRE1	Q08919	783 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	SPS1	P08458	490 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	ADH4	P10127	382 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	SSY5	P47002	699 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	YPS7	Q06325	596 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	IMP2'	P32351	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	TGL1	P34163	548 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	APM3	P38153	483 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	PTC7	P38797	343 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	CTF8	P38877	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	NDE1	P40215	560 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTS1	YOR014W	GTS1	P40956	396 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms