RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A ATP25Q03153 612 aa3.99□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A GAD1Q04792 585 aa3.99□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A YDR338CQ05497 695 aa3.99□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A ARO10Q06408 635 aa3.99□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A ADY2P25613 283 aa3.98□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A EMP70P32802 667 aa3.98□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A ATG11Q12527 1178 aa3.98□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A SFB3P38810 929 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A NDC80P40460 691 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A ALY2P47029 1046 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A THI7Q05998 598 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR001C-AYMR001C-A UBS1P38290 277 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YHR112CP38716 378 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A FMO1P38866 432 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A REV7P38927 245 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A LYS9P38999 446 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A TAF3Q12297 353 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A SIR3P06701 978 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A DMC1P25453 334 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.95□□□□□ -1.78not detected
YMR001C-AYMR001C-A CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YBP2P53169 641 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A COQ11Q05892 277 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A Q0142Q9ZZW4 58 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YLR149CQ99296 730 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A SPO11P23179 398 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ECM1P39715 212 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YAP1802P53309 568 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A MLH3Q12083 715 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A GAL11P19659 1081 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A PHO11P35842 467 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A PHO12P38693 467 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A NUP60P39705 539 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YJL049WP47048 450 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A CTR1P49573 406 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ARG5,6Q01217 863 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A AFT2Q08957 416 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A GLG1P36143 616 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A YEL020CP39994 560 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A FHN1P53279 174 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A HOF1Q05080 669 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR001C-AYMR001C-A ERR1P0CX10 437 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ERR2P0CX11 437 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MCD4P36051 919 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A GDH3P39708 457 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ARG2P40360 574 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A YFL052WP43551 465 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ORC4P54791 529 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MTC2P34246 357 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A BDH2P39713 417 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A GET2P40056 285 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MAL11P53048 616 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ATG4P53867 494 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A BNA2P47125 453 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A NSE3Q05541 303 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A USV1Q12132 391 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ZRT2Q12436 422 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A THR1P17423 357 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A SET3P36124 751 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A YKR051WP36142 418 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A NPY1P53164 384 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A RPN13O13563 156 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A CDC9P04819 755 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A APT2P36973 181 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A YNL195CP40168 261 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MCM21Q06675 368 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A YAP7Q08182 245 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A MIH1P23748 554 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ICT1Q12385 394 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.79not detected
YMR001C-AYMR001C-A FUB1P25659 250 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A STO1P34160 861 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A CRP1P38845 465 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A COX18P53239 316 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR001C-AYMR001C-A ECM3Q99252 613 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.6 ms