RNA–Protein interactions for RNA: YML118W

NGL3, Transcript of 3'-5' exonuclease specific for poly-A RNAs, yeast

Gene NGL3, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NGL3	YML118W	ESL1	P40456	1118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SWI6	P09959	803 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	BLI1	P35727	113 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RRN3	P36070	627 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RAD26	P40352	1085 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	HFM1	P51979	1187 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YOR022C	Q12204	715 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	ARP7	Q12406	477 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NSI1	Q12457	570 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NHA1	Q99271	985 aa		5	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	STE13	P33894	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	FLR1	P38124	548 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YFL066C	P43538	392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	PCL10	P53124	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NSG2	P53898	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SDH1	Q00711	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	THI21	Q08975	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NGG1	P32494	702 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SDS22	P36047	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YKR075C	P36155	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	APM3	P38153	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	POA1	P38218	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	EAF5	P39995	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	VID28	P40547	921 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	BNA1	P47096	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	ZIP2	P53061	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	ARP4	P80428	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	EAR1	Q03212	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SPC19	Q03954	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	XYL2	Q07993	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RSB1	Q08417	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SVS1	Q12254	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	YHL012W	P38709	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	PPE1	P38796	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	VPS8	P39702	1274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	STL1	P39932	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SMK1	P41808	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	PUS2	P53167	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	PSF3	Q12146	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	AI1	P03875	834 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	CDC26	P14724	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	HXT4	P32467	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RPD3	P32561	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	XRS2	P33301	854 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SEG2	P34250	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	RRM3	P38766	723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	BEM4	P39011	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SPC72	P39723	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SDH5	Q08230	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NGL3	YML118W	SAM35	P14693	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	SAN1	P22470	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	TFC3	P34111	1160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	TGL1	P34163	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	YHR202W	P38887	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	IRC5	P43610	853 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	MAD3	P47074	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
NGL3	YML118W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	ENT1	Q12518	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	ADH4	P10127	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	SLC1	P33333	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	VTC2	P43585	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
NGL3	YML118W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	SGD1	Q06132	899 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	RSC58	Q07979	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	MCH5	Q08777	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	YCL049C	P25577	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	DGR2	P32330	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	TOA1	P32773	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NGL3	YML118W	MDL2	P33311	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.9 ms