RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TAT1	P38085	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	MCM7	P38132	845 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	LSB6	P42951	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RET2	P43621	546 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YGR153W	P48238	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RSC58	Q07979	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GUP2	Q08929	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	FUN30	P31380	1131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PPH3	P32345	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YKU70	P32807	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	REC104	P33323	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SEG2	P34250	1132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	EMC3	P36039	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	MCD4	P36051	919 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ECM9	Q02202	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CIA1	Q05583	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SGD1	Q06132	899 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CYB2	P00175	591 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BRF1	P29056	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YRO2	P38079	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PNT1	P38969	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ZIP2	P53061	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YGR016W	P53209	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TEP1	P53916	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	HFI1	Q12060	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SEM1	O94742	89 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	HMG1	P12683	1054 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ALG14	P38242	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NEM1	P38757	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TDA3	P38758	523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	IRC6	P43615	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GPI8	P49018	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YNR040W	P53736	256 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	VPS9	P54787	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ERO1	Q03103	563 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NHX1	Q04121	633 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	HLR1	Q04429	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	MET7	Q08645	548 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	KRE5	P22023	1365 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SPT7	P35177	1332 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PGS1	P25578	521 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	DAL3	P32459	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ATG14	P38270	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PPE1	P38796	400 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TOK1	P40310	691 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GYP8	P43570	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ASK10	P48361	1146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NIT3	P49954	291 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BUD9	P53226	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GIS4	Q04233	774 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	TAH18	Q12181	623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SFI1	Q12369	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ARP7	Q12406	477 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ENT1	Q12518	454 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MTF2	P10849	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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