RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	VID28	P40547	921 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CYT1	P07143	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RPC31	P17890	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	OPI1	P21957	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RSC6	P25632	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PDR3	P33200	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CSE1	P33307	960 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	HEL1	P36113	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	ALG2	P43636	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TAF1	P46677	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	NUT1	P53114	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SDH5	Q08230	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	DSE3	Q08729	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PLP2	Q12017	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	REC8	Q12188	680 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SLP1	Q12232	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	LAA1	P39526	2014 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CIT1	P00890	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	UBP11	P36026	717 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	GIP4	P39732	760 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YIL092W	P40497	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SDS3	P40505	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	ASE1	P50275	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	MRX10	Q05648	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RER2	P35196	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YAP1801	P38856	637 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	GYP8	P43570	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YGR130C	P53278	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	MRPS35	P53292	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	ORC4	P54791	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TMN2	Q04562	672 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	HAP2	P06774	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SIR1	P21691	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YAT1	P80235	687 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PHM6	Q05637	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	CHS2	P14180	963 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	IMP2'	P32351	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SCD5	P34758	872 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	ATG19	P35193	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
MRPL20	YKR085C	DUG2	P38149	878 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PPX1	P38698	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	OCA5	P38738	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	NEM1	P38757	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	UBP5	P39944	805 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	NMA2	P53204	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	TFC6	Q06339	672 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	MPD2	Q99316	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL20	YKR085C	RAD50	P12753	1312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	HSF1	P10961	833 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	KIP1	P28742	1111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	TMT1	P32643	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	HMT1	P38074	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RGD1	P38339	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL20	YKR085C	CHS6	P40955	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	COQ9	Q05779	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
MRPL20	YKR085C	CDC45	Q08032	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL20	YKR085C	GLN3	P18494	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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