RNA–Protein interactions for RNA: YKL018W

SWD2, Transcript of Subunit of the COMPASS (Set1C) histone H3K4 methyltransferase complex, yeast

Gene SWD2, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SWD2	YKL018W	IRC13	Q08630	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SWD2	YKL018W	TGL5	Q12043	749 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SWD2	YKL018W	CDC43	P18898	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	HXT16	P47185	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	NPY1	P53164	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	ASM4	Q05166	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	PHO8	P11491	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	APT2	P36973	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	SDS3	P40505	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MTC2	P34246	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	REV7	P38927	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MNN1	P39106	762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	FMP52	P40008	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	SSL2	Q00578	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	TSR4	P25040	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MCD4	P36051	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	SGO1	Q08490	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	CDC9	P04819	755 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	KIN3	P22209	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	VBA3	P25594	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	THI4	P32318	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	BCD1	P38772	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	ECM1	P39715	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	GPR1	Q12361	961 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	HOS4	P40480	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	CAF16	P43569	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	UBC11	P52492	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	TEL2	P53038	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MDM12	Q92328	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	HSL7	P38274	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YJR142W	P47173	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	MAL11	P53048	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YAP1802	P53309	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	NHX1	Q04121	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SWD2	YKL018W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	TDP1	P38319	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	DMC1	P25453	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	HOG1	P32485	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	PEX6	P33760	1030 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YHR112C	P38716	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	SNM1	P40993	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	BAP3	P41815	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YGL081W	P53156	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	SRD1	P09007	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	RAD18	P10862	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	HIR1	P32479	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YKR051W	P36142	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	MTL1	P53214	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	COX18	P53239	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	UGO1	Q03327	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	MCM21	Q06675	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	MEF1	P25039	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	MSH2	P25847	964 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	PPZ2	P33329	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	SFB3	P38810	929 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	NUP60	P39705	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	ATF1	P40353	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	REC102	Q02721	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	TOM20	P35180	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	FMO1	P38866	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YJL206C	P39529	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	YJR008W	P47085	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	PCL10	P53124	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SWD2	YKL018W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.8 ms