RNA–Protein interactions for RNA: YKR027W

BCH2, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene BCH2, Length 2,298 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCH2	YKR027W	HXT16	P47185	567 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	TIM10	P87108	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	TAH18	Q12181	623 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	ARP7	Q12406	477 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	LDB19	Q12502	818 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	MTF2	P10849	440 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	DUN1	P39009	513 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	SPC72	P39723	622 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	AXL1	P40851	1208 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	VPS53	P47061	822 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	BFA1	P47113	574 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	HSP42	Q12329	375 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
BCH2	YKR027W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
BCH2	YKR027W	SPT7	P35177	1332 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SEM1	O94742	89 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	DAL7	P21826	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	RPC53	P25441	422 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PGS1	P25578	521 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PER1	P25625	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	FAT1	P38225	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CCZ1	P38273	704 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SMK1	P41808	388 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ENV11	P53246	860 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	NGG1	P32494	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	VRP1	P37370	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	VTI1	Q04338	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	OMS1	Q06668	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YIG1	Q08956	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YKL151C	P36059	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	LAM1	P38851	1228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	AXL2	P38928	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YNL058C	P53947	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SPP1	Q03012	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	TRM8	Q12009	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YCL049C	P25577	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	DAL1	P32375	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	DPH2	P32461	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CBF2	P32504	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	RRF1	P38771	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YEL068C	P39977	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YER010C	P40011	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	LSB6	P42951	607 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YHM2	Q04013	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	VID22	Q05934	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PTC5	Q12511	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SDH2	P21801	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	HSL7	P38274	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ZIP2	P53061	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SSL2	Q00578	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	NUR1	Q12066	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CDC16	P09798	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	ACE2	P21192	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SLC1	P33333	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	APM3	P38153	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	JEM1	P40358	645 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PHO3	P24031	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	MTH1	P35198	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SAP30	P38429	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	YHR202W	P38887	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	MXR1	P40029	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	PUG1	P40100	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	FET4	P40988	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	VTC4	P47075	721 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCH2	YKR027W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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