RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MSS18	P08593	268 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	AGP1	P25376	633 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DMC1	P25453	334 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MSH1	P25846	959 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MGM1	P32266	881 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YUH1	P35127	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MCD4	P36051	919 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	NIT2	P47016	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CGR1	P53188	120 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	JJJ1	P53863	590 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	APP1	P53933	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	FRA1	Q07825	749 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TAF3	Q12297	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	STE11	P23561	717 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	GPI10	P30777	616 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SET3	P36124	751 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ECM4	P36156	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SLI15	P38283	698 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MGS1	P40151	587 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YFL034W	P43564	1073 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YPL071C	Q02864	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BUD14	P27637	709 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ITR1	P30605	584 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	HIR2	P32480	875 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SUV3	P32580	737 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LTV1	P34078	463 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	VBA5	P36172	582 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PPE1	P38796	400 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YEL023C	P39992	682 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PFD1	P46988	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MAL11	P53048	616 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TBF1	Q02457	562 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SHE9	Q04172	456 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	GYL1	Q04322	720 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CLC1	P17891	233 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	UIP5	P36137	443 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PXL1	P36166	706 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CCZ1	P38273	704 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RGA1	P39083	1007 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PIC2	P40035	300 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
SET1	YHR119W	YJR096W	P47137	282 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YBP2	P53169	641 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	EOS1	P53938	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	UBP2	Q01476	1272 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SED4	P25365	1065 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	GUT2	P32191	649 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DOA4	P32571	926 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MDJ1	P35191	511 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PKP1	P40530	394 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MFB1	Q04922	465 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BSC2	Q05611	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SPH1	Q06160	661 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MDM12	Q92328	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MST1	P07236	462 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	GCR1	P07261	785 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CKA1	P15790	372 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MLS1	P30952	554 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MKK2	P32491	506 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SWH1	P35845	1188 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	EMP65	P40085	556 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ATF1	P40353	525 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SMK1	P41808	388 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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