RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	MLH3	Q12083	715 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HAL9	Q12180	1030 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	KOG1	P38873	1557 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	RPN13	O13563	156 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PTP1	P25044	335 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SEC6	P32844	805 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LYS9	P38999	446 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YJL206C	P39529	758 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PAC2	P39937	518 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YEL020C	P39994	560 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	FMP52	P40008	231 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SSL2	Q00578	843 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ENV7	Q12003	364 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PIN2	Q12057	282 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	RGT2	Q12300	763 aa		1.01	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	VPS34	P22543	875 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TOK1	P40310	691 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YIR042C	P40586	236 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MPS1	P54199	764 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	VPS30	Q02948	557 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HFD1	Q04458	532 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TDA9	Q04545	1251 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TGL5	Q12043	749 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YPT7	P32939	208 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MGE1	P38523	228 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GID8	P40208	455 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LTP1	P40347	161 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	VHR1	P40522	640 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	NET1	P47035	1189 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TEL2	P53038	688 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SPO20	Q04359	397 aa		1	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PET112	P33893	541 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MEP2	P41948	499 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PFA3	P42836	336 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MRK1	P50873	501 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HEM3	P28789	327 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YHR078W	P38799	552 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MIT1	P40002	666 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		0.99	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YLR415C	O13578	112 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MPH2	P0CD99	609 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	STE4	P18851	423 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MIH1	P23748	554 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ECM1	P39715	212 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	OPI10	Q08202	246 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SWR1	Q05471	1514 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	NDC80	P40460	691 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GYP8	P43570	497 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YAP1802	P53309	568 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ATG11	Q12527	1178 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YCL002C	P25565	263 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	NGG1	P32494	702 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GLG1	P36143	616 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	FMO1	P38866	432 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	XBP1	P40489	647 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PKH1	Q03407	766 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LCD1	Q04377	747 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GAD1	Q04792	585 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YLR149C	Q99296	730 aa		0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	TOP3	P13099	656 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SET3	P36124	751 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	PET10	P36139	283 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	CEP3	P40969	608 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	CTR1	P49573	406 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GDE1	Q02979	1223 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	NRG1	Q03125	231 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	IRC20	Q06554	1556 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	ADE8	P04161	214 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	CLN2	P20438	545 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YEL1	P34225	687 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	BDH2	P39713	417 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	GET2	P40056	285 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	IRR1	P40541	1150 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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