RNA–Protein interactions for RNA: YEL064C

AVT2, Transcript of Putative transporter, yeast

Gene AVT2, Length 1,443 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT2	YEL064C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	PUS2	P53167	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	SAK1	P38990	1142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	FMP52	P40008	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	SSL2	Q00578	843 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	TGL5	Q12043	749 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	TAF3	Q12297	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AVT2	YEL064C	CLN2	P20438	545 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	SPO11	P23179	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	PFA3	P42836	336 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	TEL2	P53038	688 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	CWC24	P53769	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YTA7	P40340	1379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YLR415C	O13578	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	DMC1	P25453	334 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	REC104	P33323	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	LCD1	Q04377	747 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	STE5	P32917	917 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	HIR1	P32479	840 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YBR284W	P38150	797 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	UBS1	P38290	277 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	PZF1	P39933	429 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	GAT1	P43574	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	SSY5	P47002	699 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	UBC11	P52492	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	SCS3	P53012	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	DAM1	P53267	343 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	SVF1	Q05515	481 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	BRN1	P38170	754 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	RIM13	Q03792	727 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	ORC2	P32833	620 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	MRP8	P35719	219 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	PBY1	P38254	753 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YEL020C	P39994	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	NNF1	P47149	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	ENV7	Q12003	364 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	OCA5	P38738	679 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	NDC80	P40460	691 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
AVT2	YEL064C	GPR1	Q12361	961 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AVT2	YEL064C	YCL002C	P25565	263 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	NGG1	P32494	702 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	TPO2	P53283	614 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	PIN2	Q12057	282 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	SIC1	P38634	284 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	MAD1	P40957	749 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	PFD1	P46988	109 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	OSW1	Q08692	278 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	DAL7	P21826	554 aa		4	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	IRR1	P40541	1150 aa		4	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	DOS2	P54858	310 aa		4	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	PRC1	P00729	532 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	YBR184W	P38299	523 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	BAP3	P41815	604 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	TAD1	P53065	400 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	SIR3	P06701	978 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	TOP3	P13099	656 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	ALR2	P43553	858 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	VPS34	P22543	875 aa		3.96	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	SFB3	P38810	929 aa		3.96	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	RSC3	Q06639	885 aa		3.96	□□□□□ -1.77
AVT2	YEL064C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	PET10	P36139	283 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.95	□□□□□ -1.78	not detected
AVT2	YEL064C	BDH2	P39713	417 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	YAP1802	P53309	568 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	SEG1	Q04279	960 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	UBX5	Q06682	500 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	RPN13	O13563	156 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.95	□□□□□ -1.78	not detected
AVT2	YEL064C	GLG1	P36143	616 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	REV7	P38927	245 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	MTL1	P53214	551 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	THI21	Q08975	551 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AVT2	YEL064C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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