RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W ENV7Q12003 364 aa6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MSP1P28737 362 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W GIC1P38785 314 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W RRT14P40470 206 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SRT1Q03175 343 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YDR514CQ04408 483 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W RSC3Q06639 885 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W RSB1Q08417 382 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MET7Q08645 548 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YVC1Q12324 675 aa6.41□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SAM35P14693 329 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PCL2P25693 308 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W FUN30P31380 1131 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MDL2P33311 773 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MMM1P41800 426 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W CAF16P43569 289 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MTC3P53077 123 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W GPG1P53130 126 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PAP2P53632 584 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W COG8Q04632 607 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W RTT109Q07794 436 aa6.4□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MPH2P0CD99 609 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SFL1P20134 766 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W TRK2P28584 889 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W NUG1P40010 520 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YKE2P52553 114 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W HFD1Q04458 532 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YPR196WQ06595 470 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W HIM1Q06674 414 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SIR4P11978 1358 aa6.39□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W ACE2P21192 770 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W AKR1P39010 764 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W NPP2P39997 493 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W TPM2P40414 161 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W CIT3P43635 486 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W TY4A-JP47023 414 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MET13P53128 600 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W TAP42Q04372 366 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W TDA6Q06466 467 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W REH1Q06709 432 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W RSC58Q07979 502 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W THI72Q08579 599 aa6.38□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W EDE1P34216 1381 aa6.37□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SFB2P53953 876 aa6.37□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W OSW2Q12202 724 aa6.37□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YRF1-4O13559 1382 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PSK1P31374 1356 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PER1P25625 357 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W RPC82P32349 654 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MCD4P36051 919 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PRY1P47032 299 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YJR120WP47157 116 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W RCM1P53972 490 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W GUD1Q07729 489 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SVS1Q12254 260 aa6.36□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W USO1P25386 1790 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W NOT3P06102 836 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W RFA1P22336 621 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W HOG1P32485 435 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W NIT1P40447 199 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W GPP1P41277 250 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W YFL066CP43538 392 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W HFM1P51979 1187 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PEX8P53248 589 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W SDH1Q00711 640 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W AUS1Q08409 1394 aa6.35□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PCM1P38628 557 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.34□□□□□ -1.39not detected
VHS1YDR247W TRE2Q08693 809 aa6.34□□□□□ -1.39
VHS1YDR247W EUG1P32474 517 aa6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W PRP19P32523 503 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RPN10P38886 268 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YJR096WP47137 282 aa6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W NOG2P53742 486 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W ATG33Q06485 197 aa6.33□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W DAL7P21826 554 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YBR071WP38243 211 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W CKB2P38930 258 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data6.32□□□□□ -1.4not detected
VHS1YDR247W TAD1P53065 400 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W NSG2P53898 299 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data6.32□□□□□ -1.4not detected
VHS1YDR247W TRE1Q08919 783 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W GUP2Q08929 609 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YDR215CQ12240 137 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W GIN4Q12263 1142 aa6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W HMG1P12683 1054 aa6.31□□□□□ -1.4
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