RNA–Protein interactions for RNA: YCL008C

STP22, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene STP22, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP22	YCL008C	BUD6	P41697	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
STP22	YCL008C	VPS72	Q03388	795 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ROT1	Q03691	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MET5	P47169	1442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	DAL5	P15365	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	GAL11	P19659	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	PET10	P36139	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	BET3	P36149	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
STP22	YCL008C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	TOK1	P40310	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YKE2	P52553	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RTA1	P53047	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	LCD1	Q04377	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MSP1	P28737	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MEF2	P39677	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YIL092W	P40497	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CDA1	Q06702	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	EDE1	P34216	1381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	BNI1	P41832	1953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	KRE5	P22023	1365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RPC82	P32349	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SRP101	P32916	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SPC42	P36094	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	MND2	P40577	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	GCN5	Q03330	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	DUS4	Q06063	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STP22	YCL008C	SOD2	P00447	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	CIT2	P08679	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ENA1	P13587	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TIM23	P32897	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	SWE1	P32944	819 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	REC104	P33323	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	RIM8	P53179	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YGR012W	P53206	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	RAD9	P14737	1309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	CDC6	P09119	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	HSF1	P10961	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	PRD1	P25375	712 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	DOM34	P33309	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YJR008W	P47085	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	DOS2	P54858	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	THI22	Q06490	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TPO1	Q07824	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	SIR4	P11978	1358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	QCR6	P00127	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	THI80	P35202	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	NUP82	P40368	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ATG36	P46983	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	GCV2	P49095	1034 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ADY3	Q07732	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	GPB1	Q08886	897 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	HMI1	Q12039	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	EMC1	P25574	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	POA1	P38218	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	SPT20	P50875	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	VPS62	P53285	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	RXT3	Q07458	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	ENV7	Q12003	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	SPE1	P08432	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	CDC20	P26309	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	TOD6	P34219	525 aa		4.79	□□□□□ -1.64
STP22	YCL008C	IRC24	P40580	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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