RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C UBA2P52488 636 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YPR196WQ06595 470 aa2.75□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C GRX1P25373 110 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C QRI1P43123 477 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C OMS1Q06668 471 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ERG4P25340 473 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C PET10P36139 283 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TPO2P53283 614 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data2.74□□□□□ -1.97not detected
HDA3YPR179C YKR011CQ02209 353 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C HBN1Q96VH4 193 aa2.74□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SCT1P32784 759 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C REC104P33323 182 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C CTF13P35203 478 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C SUL1P38359 859 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TMN2Q04562 672 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C MCH5Q08777 521 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ENV7Q12003 364 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ACF2Q12168 779 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TRM13Q12383 476 aa2.73□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C RPD3P32561 433 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C ALR2P43553 858 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C TIM44Q01852 431 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C RNT1Q02555 471 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C CDC11P32458 415 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C STU2P46675 888 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C VPS30Q02948 557 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C YPR071WQ12346 211 aa2.72□□□□□ -1.97
HDA3YPR179C MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C PRP4P20053 465 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C STB4P50104 949 aa2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ERP6P53198 216 aa2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C PEX19Q07418 342 aa2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C TRM11Q12463 433 aa2.71□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MPH2P0CD99 609 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C CAD1P24813 409 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C UBX5Q06682 500 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C SPO75Q07798 868 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C IRC10Q08118 586 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C TOP3P13099 656 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RFA1P22336 621 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YBR284WP38150 797 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C TAF8Q03750 510 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C EAF1Q06337 982 aa2.7□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ALG7P07286 448 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RAD4P14736 754 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C EMC3P36039 253 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YHR078WP38799 552 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ATF1P40353 525 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C CEP3P40969 608 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YJL049WP47048 450 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
HDA3YPR179C MRPS35P53292 345 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ASI2P53895 289 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C CIT1P00890 479 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C HAL9Q12180 1030 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C GPR1Q12361 961 aa2.69□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C HSP60P19882 572 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MTH1P35198 433 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C BET3P36149 193 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C GYP8P43570 497 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C DUS1P53759 423 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C BDF2Q07442 638 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C THI21Q08975 551 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C SWM1Q12379 170 aa2.68□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ARE1P25628 610 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YBR053CP38235 358 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RPP1P38786 293 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ADY4Q05955 493 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C FRE5Q08908 694 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C OSH2Q12451 1283 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C CUE2P36075 443 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ELO3P40319 345 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C VHR1P40522 640 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C TY4A-JP47023 414 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C NNF1P47149 201 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C HXT16P47185 567 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MUK1Q02866 612 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C DLT1Q04216 342 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C NDJ1Q12366 352 aa2.67□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RPS9AO13516 197 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YCL002CP25565 263 aa2.66□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RTA1P53047 317 aa2.66□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C ATP25Q03153 612 aa2.66□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YMR206WQ03695 313 aa2.66□□□□□ -1.98
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