RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SHE9Q04172 456 aa10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TFC4P33339 1025 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W YKL050CP35736 922 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GAA1P39012 614 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SPC72P39723 622 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W APL6P46682 809 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W VID30P53076 958 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ERP6P53198 216 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W NNF2P53253 936 aa10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FLO1P32768 1537 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W KEX2P13134 814 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W VMA4P22203 233 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W TRK2P28584 889 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FZO1P38297 855 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W ESBP6P53918 673 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SHR3Q02774 210 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FUS2Q05670 677 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W OSW1Q08692 278 aa10.97□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W PFK1P16861 987 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SPO16P17122 198 aa10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W GCD6P32501 712 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W FIG4P42837 879 aa10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W BRO1P48582 844 aa10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W SAS4Q04003 481 aa10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W AIM33Q04516 312 aa10.96□□□□□ -0.65
PRP4YPR178W PWP1P21304 576 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SSE1P32589 693 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W HIS2P38635 335 aa10.95□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PCL10P53124 433 aa10.95□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data10.94□□□□□ -0.66not detected
PRP4YPR178W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SWI6P09959 803 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W KIP2P28743 706 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W VPS35P34110 944 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W RRT2P38332 387 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PPX1P38698 397 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PIH1P38768 344 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W VPS45P38932 577 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SIP5P40210 489 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W ATG36P46983 293 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YGR273CP53329 174 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W BET4Q00618 327 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YDL057WQ07379 328 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W MPC54Q08550 464 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YPL277CQ08989 487 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W OCA6Q12454 224 aa10.94□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SNF1P06782 633 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SCJ1P25303 377 aa10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SEC21P32074 935 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W GVP36P40531 326 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W UBP6P43593 499 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PGA2P53903 129 aa10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YNL011CP53980 444 aa10.93□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W ILV2P07342 687 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SRM1P21827 482 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PRE8P23639 250 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W CHS3P29465 1165 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W MRE11P32829 692 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W HSM3P38348 480 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SSP1P38871 571 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W END3P39013 349 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W ATG1P53104 897 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W HPC2Q01448 625 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W GTB1Q04924 702 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W IRC3Q06683 689 aa10.92□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W ILV1P00927 576 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W CLN3P13365 580 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SIT4P20604 311 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W REC107P21651 314 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PWP2P25635 923 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W RPL5P26321 297 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SIN4P32259 974 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data10.91□□□□□ -0.66not detected
PRP4YPR178W YBR032WP38223 100 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W EMW1P42842 904 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PUS6P53294 404 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W HFD1Q04458 532 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W SKG3Q06315 1026 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W ACM1Q08981 209 aa10.91□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W PCK1P10963 549 aa10.9□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W VHC1P38329 1120 aa10.9□□□□□ -0.66
PRP4YPR178W MSG5P38590 489 aa10.9□□□□□ -0.66
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