RNA–Protein interactions for RNA: YOR258W

HNT3, Transcript of DNA 5' AMP hydrolase involved in DNA repair, yeast

Gene HNT3, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HNT3	YOR258W	MNN1	P39106	762 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
HNT3	YOR258W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	RPC82	P32349	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	RNT1	Q02555	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	ACF2	Q12168	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	PHO8	P11491	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YBR184W	P38299	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YJR008W	P47085	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	GYP7	P48365	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TIM44	Q01852	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	FLC1	Q08967	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	ALG7	P07286	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	STE5	P32917	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YER158C	P40095	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YJR142W	P47173	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	PPH3	P32345	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	THI4	P32318	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	STE14	P32584	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TOM20	P35180	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	ATG36	P46983	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	MUK1	Q02866	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	OMS1	Q06668	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TRM13	Q12383	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	AGP1	P25376	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	UBX5	Q06682	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	PEX19	Q07418	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SPO75	Q07798	868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	IRC10	Q08118	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	GRX4	P32642	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	VBA5	P36172	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	ATF1	P40353	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	RTS3	P53289	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	VPS30	Q02948	557 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	ADE8	P04161	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	GAL11	P19659	1081 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	ARE1	P25628	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	GND2	P53319	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	FMP25	Q08023	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CIT1	P00890	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CAN1	P04817	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	RPD3	P32561	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	STE13	P33894	931 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	MTH1	P35198	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	DNM1	P54861	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	EAF1	Q06337	982 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	MRP8	P35719	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	YRO2	P38079	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	IRR1	P40541	1150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
HNT3	YOR258W	PFD1	P46988	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	NPP1	P25353	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	YEN1	P40028	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	RTA1	P53047	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	ERP6	P53198	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	ERG5	P54781	538 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SHE9	Q04172	456 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	SWM1	Q12379	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HNT3	YOR258W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	UBP12	P39538	1254 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	CEP3	P40969	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	ALR2	P43553	858 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	FRE5	Q08908	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HNT3	YOR258W	ADR1	P07248	1323 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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