RNA–Protein interactions for RNA: YMR204C

INP1, Transcript of Peripheral membrane protein of peroxisomes, yeast

Gene INP1, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP1	YMR204C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	FBP1	P09201	348 aa		5.11	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	ERG5	P54781	538 aa		5.11	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	TRM13	Q12383	476 aa		5.11	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	CEP3	P40969	608 aa		5.1	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	LCD1	Q04377	747 aa		5.1	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	CTF13	P35203	478 aa		5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	SWM1	Q12379	170 aa		5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	TRM11	Q12463	433 aa		5.09	□□□□□ -1.59
INP1	YMR204C	STE5	P32917	917 aa		5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	ERT1	P38140	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	CTF8	P38877	133 aa		5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	MUK1	Q02866	612 aa		5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	IRC10	Q08118	586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	MET3	P08536	511 aa		5.07	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	REC104	P33323	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	YBR184W	P38299	523 aa		5.07	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	TOK1	P40310	691 aa		5.07	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	SCT1	P32784	759 aa		5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	HDA1	P53973	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	DLT1	Q04216	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	FRE5	Q08908	694 aa		5.06	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	CDC11	P32458	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	ELO3	P40319	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	YPR071W	Q12346	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	MTH1	P35198	433 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	YHR078W	P38799	552 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	ALR2	P43553	858 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	PFD1	P46988	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	PUS2	P53167	370 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	GND2	P53319	492 aa		5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	SPC42	P36094	363 aa		5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	YBR284W	P38150	797 aa		5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	RPP1	P38786	293 aa		5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	ATF1	P40353	525 aa		5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	DAS1	P47005	663 aa		5.03	□□□□□ -1.6
INP1	YMR204C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
INP1	YMR204C	PPS1	P38148	807 aa		5.02	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	FKH2	P41813	862 aa		5.02	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	FMP25	Q08023	583 aa		5.02	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	YHL017W	P38745	532 aa		5.01	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	ADY4	Q05955	493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	SDS3	P40505	327 aa		5	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	VHR1	P40522	640 aa		5	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	PKH1	Q03407	766 aa		5	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	SPO75	Q07798	868 aa		5	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	PET10	P36139	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	MUP1	P50276	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	MRPS35	P53292	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	EAF1	Q06337	982 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	UBX5	Q06682	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	ENV7	Q12003	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	NGG1	P32494	702 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	NIT3	P49954	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	ERP6	P53198	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	ASI2	P53895	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	CRR1	Q05790	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	PZF1	P39933	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	BDF2	Q07442	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
INP1	YMR204C	AMA1	P50082	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	ARE1	P25628	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	YBR053C	P38235	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	YJL163C	P46996	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	PRC1	P00729	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
INP1	YMR204C	DAL7	P21826	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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