RNA–Protein interactions for RNA: YMR073C

IRC21, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene IRC21, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC21	YMR073C	MSS4	P38994	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	TOK1	P40310	691 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	CEP3	P40969	608 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	RAD4	P14736	754 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	YPT53	P36019	220 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	PET10	P36139	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	PUS2	P53167	370 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	SWM1	Q12379	170 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	YBR284W	P38150	797 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	SDP1	P40479	209 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	TIM54	P47045	478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	UBX5	Q06682	500 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	CIT1	P00890	479 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	FBP1	P09201	348 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	NGG1	P32494	702 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	STE14	P32584	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	DAM1	P53267	343 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	KIN4	Q01919	800 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	PEX19	Q07418	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IRC21	YMR073C	CTF8	P38877	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
IRC21	YMR073C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ERG4	P25340	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	SUL1	P38359	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	CHS7	P38843	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	NNF1	P47149	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	TRM11	Q12463	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	RPD3	P32561	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	YHR078W	P38799	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	HDA1	P53973	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	TIM44	Q01852	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	RNT1	Q02555	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	REH1	Q06709	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	FLC1	Q08967	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ENV7	Q12003	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	MET3	P08536	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
IRC21	YMR073C	GAL11	P19659	1081 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	OAR1	P35731	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	CTF13	P35203	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	EMC3	P36039	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	SAP190	P36123	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	PZF1	P39933	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	UBA2	P52488	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	SLI1	P53304	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	TAF8	Q03750	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	DLT1	Q04216	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	LAS17	Q12446	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ERT1	P38140	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	HUL5	P53119	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	PKH1	Q03407	766 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	PRC1	P00729	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	TOP3	P13099	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	DAL7	P21826	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	RAD53	P22216	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ALG2	P43636	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	OMS1	Q06668	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	ACF2	Q12168	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IRC21	YMR073C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	ALG7	P07286	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	MOH1	P38191	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	RPP1	P38786	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	RSC3	Q06639	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	PPM2	Q08282	695 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	CAN1	P04817	590 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	VHR1	P40522	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	DAS1	P47005	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	BUL1	P48524	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	AMA1	P50082	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	ASI2	P53895	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IRC21	YMR073C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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