RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A TOK1P40310 691 aa4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SDP1P40479 209 aa4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A IRR1P40541 1150 aa4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A BUL2Q03758 920 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A PPR1P07272 904 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A TUB3P09734 445 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A NAP1P25293 417 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A YBR284WP38150 797 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SIT1P39980 628 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A HDA1P53973 706 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A VPS30Q02948 557 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SVF1Q05515 481 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A TDA5Q06417 326 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A OMS1Q06668 471 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A ACF2Q12168 779 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A YPR071WQ12346 211 aa4.26□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A CTF13P35203 478 aa4.25□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A PFD1P46988 109 aa4.25□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A YKR011CQ02209 353 aa4.25□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A TYE7P33122 291 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A PPS1P38148 807 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A CTF8P38877 133 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A CCM1P48237 864 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A GND2P53319 492 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A LCD1Q04377 747 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A IRC10Q08118 586 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A FRE5Q08908 694 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SWM1Q12379 170 aa4.24□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A PRP4P20053 465 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A REC104P33323 182 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A MTH1P35198 433 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A FKH2P41813 862 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A QRI1P43123 477 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A ALR2P43553 858 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A STU2P46675 888 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A TPO2P53283 614 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A MRPS35P53292 345 aa4.23□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A URA1P28272 314 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SPC42P36094 363 aa4.22□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A UBX5Q06682 500 aa4.22□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A TRM11Q12463 433 aa4.22□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A PRP9P19736 530 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A RPP1P38786 293 aa4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A YHR078WP38799 552 aa4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A ELO3P40319 345 aa4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A TIM44Q01852 431 aa4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A FMP25Q08023 583 aa4.21□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A RPS9AO13516 197 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A MET3P08536 511 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A GRX1P25373 110 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A VHR1P40522 640 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A DLT1Q04216 342 aa4.2□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A CAF20P12962 161 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A ATF1P40353 525 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A MUP1P50276 574 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A PUS2P53167 370 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A HAL9Q12180 1030 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A HBN1Q96VH4 193 aa4.19□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A TOP3P13099 656 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A SDS3P40505 327 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A ADY4Q05955 493 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A EAF1Q06337 982 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A ENV7Q12003 364 aa4.18□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A CYS3P31373 394 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A CDC11P32458 415 aa4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A ASI2P53895 289 aa4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A MPH2P0CD99 609 aa4.16□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A PET10P36139 283 aa4.16□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A DUS1P53759 423 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A YOR022CQ12204 715 aa4.16□□□□□ -1.74
YMR001C-AYMR001C-A DAL7P21826 554 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A YCL002CP25565 263 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A ARE1P25628 610 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A PEX2P32800 271 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A YBR053CP38235 358 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A YHL017WP38745 532 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A SAK1P38990 1142 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A PKH1Q03407 766 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A CRR1Q05790 422 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A WRS1Q12109 432 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A SUT2Q12286 268 aa4.15□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A CUE2P36075 443 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A SNM1P40993 198 aa4.14□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data4.14□□□□□ -1.75not detected
YMR001C-AYMR001C-A SNU71P53207 620 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A LRS4Q04087 347 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.14□□□□□ -1.75not detected
YMR001C-AYMR001C-A PCL5P38794 229 aa4.13□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A GGA2P38817 585 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A PZF1P39933 429 aa4.13□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A YJL163CP46996 555 aa4.13□□□□□ -1.75
YMR001C-AYMR001C-A SSY5P47002 699 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.8 ms