RNA–Protein interactions for RNA: YJL203W

PRP21, Transcript of Subunit of the SF3a splicing factor complex, yeast

Gene PRP21, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP21	YJL203W	HDA1	P53973	706 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRP21	YJL203W	VPS30	Q02948	557 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRP21	YJL203W	FMP25	Q08023	583 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRP21	YJL203W	TRM13	Q12383	476 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRP21	YJL203W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	PEX19	Q07418	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	REC104	P33323	182 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	YPT53	P36019	220 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	CTF8	P38877	133 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	CEP3	P40969	608 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	ALR2	P43553	858 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	UBA2	P52488	636 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	YBR284W	P38150	797 aa		5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	STB4	P50104	949 aa		5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
PRP21	YJL203W	RNT1	Q02555	471 aa		5	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	ALG7	P07286	448 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	CTF13	P35203	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	TMN2	Q04562	672 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	UBX5	Q06682	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	CDC11	P32458	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	OMS1	Q06668	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	EAF1	Q06337	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	MCH5	Q08777	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	ACF2	Q12168	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	SWM1	Q12379	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	TRM11	Q12463	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRP21	YJL203W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	PET10	P36139	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	YHR078W	P38799	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	MUK1	Q02866	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	ENV7	Q12003	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	SPO75	Q07798	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	TOP3	P13099	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	ERP6	P53198	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	MRPS35	P53292	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	FRE5	Q08908	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	ARE1	P25628	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	RPP1	P38786	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	DLT1	Q04216	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	MET3	P08536	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	SCT1	P32784	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	ELO3	P40319	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	FKH2	P41813	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PRP21	YJL203W	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	RAD4	P14736	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	PPS1	P38148	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	STU2	P46675	888 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	TIM44	Q01852	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	YML122C	Q03207	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	IRC10	Q08118	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP21	YJL203W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	MTH1	P35198	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	MUP1	P50276	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	ADY4	Q05955	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	DAL7	P21826	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	NIT3	P49954	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	YCL002C	P25565	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	SPC42	P36094	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	PKH1	Q03407	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	EMC3	P36039	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	YBR053C	P38235	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	PZF1	P39933	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	GYP8	P43570	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP21	YJL203W	TAD1	P53065	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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