RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W IQG1Q12280 1495 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CIT1P00890 479 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GAL10P04397 699 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W LAM1P38851 1228 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CCC2P38995 1004 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W HUL4P40985 892 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CDA2Q06703 312 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W SRM1P21827 482 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RPC82P32349 654 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YRO2P38079 344 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W XYL2Q07993 356 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NUP159P40477 1460 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RNQ1P25367 405 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GGA2P38817 585 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W AIM44Q99299 758 aa4.74□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W MEF2P39677 819 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YER158CP40095 573 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ROT1Q03691 256 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W LCD1Q04377 747 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W PLB2Q03674 706 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W HBN1Q96VH4 193 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W SRB8P25648 1427 aa4.73□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W SOD2P00447 233 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RSP5P39940 809 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ZRG8P40021 1076 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RIM8P53179 542 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W RPN4Q03465 531 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YPR196WQ06595 470 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NTE1Q04958 1679 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NPP1P25353 742 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W AFR1P33304 620 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YBR284WP38150 797 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W AIM3P38266 947 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NPP2P39997 493 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W IRC24P40580 263 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
HCA4YJL033W GCN5Q03330 439 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W TAF8Q03750 510 aa4.72□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ENA1P13587 1091 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W GAL11P19659 1081 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W TAF5P38129 798 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W CWC22P53333 577 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W SFB2P53953 876 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W ENA2Q01896 1091 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YPL277CQ08989 487 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YPR071WQ12346 211 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W ENA5Q12691 1091 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W IRC20Q06554 1556 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W REC104P33323 182 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W PET10P36139 283 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W MND2P40577 368 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YKE2P52553 114 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YGR012WP53206 393 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YDR132CQ03900 495 aa4.71□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W CAN1P04817 590 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W HSF1P10961 833 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W DOM34P33309 386 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W OPY1P38271 328 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W DUS4Q06063 367 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W RXT3Q07458 294 aa4.7□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W UBP5P39944 805 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W TOK1P40310 691 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W GPB1Q08886 897 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W SPO14P36126 1683 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W SRP101P32916 621 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W POA1P38218 177 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W SPT20P50875 604 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W EAF7P53911 425 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W CDA1Q06702 301 aa4.69□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W UBP6P43593 499 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W CAT8P39113 1433 aa4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W YSP2Q06681 1438 aa4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W TOP3P13099 656 aa4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W TOD6P34219 525 aa4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W FPR3P38911 411 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W OSW7P43611 510 aa4.68□□□□□ -1.66
HCA4YJL033W TPO1Q07824 586 aa4.68□□□□□ -1.66
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