RNA–Protein interactions for RNA: YDR291W

HRQ1, Transcript of 3'-5' DNA helicase that has DNA strand annealing activity, yeastyeast

Gene HRQ1, Length 3,234 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1YDR291W VPS29P38759 282 aa6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W COS5P47187 383 aa6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TDA9Q04545 1251 aa6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YOL087CQ99247 1116 aa6.71□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SHP1P34223 423 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YJR079WP47126 109 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TIM8P57744 87 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W EEB1Q02891 456 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SPT21P35209 758 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W OCT1P35999 772 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W VPS41P38959 992 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W CWC22P53333 577 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W URH1Q04179 340 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR018WQ04364 514 aa6.7□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SNF1P06782 633 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W CDC42P19073 191 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W UTR4P32626 227 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W COT1P32798 439 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W UBP13P38187 747 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PHO86P46956 311 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YJR039WP47107 1121 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR187CQ03236 431 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W COQ9Q05779 260 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W GIS3Q12418 502 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RIM8P53179 542 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W DUS4Q06063 367 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RPS3P05750 240 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PEP5P12868 1029 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ERC1P38767 581 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PEA2P40091 420 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YNL320WP42840 284 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SQS1P53866 767 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YDR278CQ05612 105 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SPO21Q12411 609 aa6.69□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PRP9P19736 530 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W NIP100P33420 868 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SLI15P38283 698 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.68□□□□□ -1.34not detected
HRQ1YDR291W CRD1Q07560 283 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W CDC8P00572 216 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W EUG1P32474 517 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W JNM1P36224 373 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W NPP2P39997 493 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PXA1P41909 870 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YMR321CQ04898 105 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W STE23Q06010 1027 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W IES4Q08561 116 aa6.68□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W QCR6P00127 147 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ADE3P07245 946 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W BLI1P35727 113 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W MCD4P36051 919 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W GPB2P39717 880 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RPN3P40016 523 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YDR222WQ04925 415 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PUS5Q06244 254 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TKL1P23254 680 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TVP38P36164 337 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W HMF1P40037 129 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ASG1P40467 964 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W NET1P47035 1189 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ERV41Q04651 352 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SLX4Q12098 748 aa6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W DBP5P20449 482 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RME1P32338 300 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W MUD1P32605 298 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W DED1P06634 604 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W SFL1P20134 766 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YKR018CP36114 725 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YGR125WP53273 1036 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W CHS2P14180 963 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RNR1P21524 888 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YKL050CP35736 922 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W END3P39013 349 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa6.66□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W KIN82P25341 720 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W VAB2P40003 282 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YTA12P40341 825 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RAD26P40352 1085 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W NMD5P46970 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W ZAP1P47043 880 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W AVT1P47082 602 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W RTT102P53330 157 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YLR462WO13556 202 aa6.65□□□□□ -1.34
HRQ1YDR291W YHL049CP38722 271 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms