RNA–Protein interactions for RNA: YOR343W-B

YOR343W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YOR343W-B, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343W-BYOR343W-B SDP1P40479 209 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ERG5P54781 538 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PPN1Q04119 674 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ATG23Q06671 453 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B LPX1Q12405 387 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SWI6P09959 803 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NGG1P32494 702 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RRN3P36070 627 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YBR259WP38338 688 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YER158CP40095 573 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B FOX2Q02207 900 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B DUS4Q06063 367 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SLX4Q12098 748 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B TRM11Q12463 433 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B IES1P43579 692 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NIT3P49954 291 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ROD1Q02805 837 aa2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B HIS5P07172 385 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B APL2P36000 726 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SLS1P42900 643 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PEF1P53238 335 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RRI2Q12348 645 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PTC5Q12511 572 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YHL012WP38709 493 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PEA2P40091 420 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NUP82P40368 713 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MND2P40577 368 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B INP52P50942 1183 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YNL193WP53870 558 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NKP1Q12493 238 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B INO1P11986 533 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PCL2P25693 308 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B STE5P32917 917 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B TAF5P38129 798 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B IES5P40060 125 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ALD6P54115 500 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B HPF1Q05164 967 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B AVO1Q08236 1176 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NFS1P25374 497 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B KIP1P28742 1111 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ALG14P38242 237 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B KTR7P40504 517 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CCT8P47079 568 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B ASI2P53895 289 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B UBX5Q06682 500 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YPR053CQ6Q5F3 151 aa2.2□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B STE13P33894 931 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YBR071WP38243 211 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CKB2P38930 258 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B AMA1P50082 593 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NCS6P53088 359 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B NNF2P53253 936 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PKH1Q03407 766 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B HFD1Q04458 532 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YPL277CQ08989 487 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RAD4P14736 754 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PTH2P34222 208 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CLA4P48562 842 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YRB30P53107 440 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MED7Q08278 222 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B UPC2Q12151 913 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SPO21Q12411 609 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B KCS1Q12494 1050 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YGR161W-CQ3E744 92 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YBR182C-AQ8TGU6 64 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PMA1P05030 918 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RPL8AP17076 256 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PRP28P23394 588 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.19□□□□□ -2.06not detected
YOR343W-BYOR343W-B PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B YJL206CP39529 758 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B TPM2P40414 161 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PSP2P50109 593 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RNH70P53331 553 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RIA1P53893 1110 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B REC102Q02721 264 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B MRL1Q06815 381 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CRD1Q07560 283 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data2.19□□□□□ -2.06not detected
YOR343W-BYOR343W-B PEX15Q08215 383 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B VPS5Q92331 675 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SRD1P09007 221 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B CBP3P21560 335 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B HSL7P38274 827 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B AIR1P40507 360 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B TY4A-JP47023 414 aa2.19□□□□□ -2.06
YOR343W-BYOR343W-B SRB7P47822 140 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81.3 ms