RNA–Protein interactions for RNA: YOR197W

MCA1, Transcript of Ca2+-dependent cysteine protease, yeast

Gene MCA1, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MCA1	YOR197W	TRM2	P33753	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	CHA4	P43634	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
MCA1	YOR197W	SUN4	P53616	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SHE9	Q04172	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	NPP1	P25353	742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	STE5	P32917	917 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	PUS9	Q12069	462 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	HSF1	P10961	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	AFR1	P33304	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SLI1	P53304	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	DCG1	P32460	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	ERT1	P38140	529 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	CCC2	P38995	1004 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	MSE1	P48525	536 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YER158C	P40095	573 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	GYP7	P48365	746 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	EXG2	P52911	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	KIN4	Q01919	800 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	NPC2	Q12408	173 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	LAS17	Q12446	633 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PPH3	P32345	308 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	MRP8	P35719	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	MSS4	P38994	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	NCS6	P53088	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PNS1	Q12412	539 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YBR184W	P38299	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	AIM21	P40563	679 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PBY1	P38254	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PFD1	P46988	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YRO2	P38079	344 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	CHS7	P38843	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	IRR1	P40541	1150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YKE2	P52553	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YTA7	P40340	1379 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	KAR4	P25583	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	OCA5	P38738	679 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	NNF1	P47149	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	UPC2	Q12151	913 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MCA1	YOR197W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	RPC82	P32349	654 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	BUL1	P48524	976 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	ADE8	P04161	214 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	RPD3	P32561	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	STE14	P32584	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	ATG19	P35193	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	SIT1	P39980	628 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	TOK1	P40310	691 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	IOC3	P43596	787 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	FMP25	Q08023	583 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	YBR284W	P38150	797 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	ALR2	P43553	858 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	UBX5	Q06682	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	STE13	P33894	931 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	SED4	P25365	1065 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	CTF4	Q01454	927 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	AIM39	Q08223	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	ENB1	Q08299	606 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	TPO2	P53283	614 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	LCD1	Q04377	747 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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