RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	YFL054C	P43549	646 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NIT2	P47016	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	UBX4	P54730	416 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MET14	Q02196	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	COG8	Q04632	607 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	ATG33	Q06485	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GUD1	Q07729	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MET7	Q08645	548 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HSP78	P33416	811 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	AIM14	P53109	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	DAM1	P53267	343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GAL1	P04385	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	SAC7	P17121	654 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	DPB3	P27344	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HMG1	P12683	1054 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MET22	P32179	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HOG1	P32485	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NPP2	P39997	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	AEP2	P22136	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PER1	P25625	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	DAL3	P32459	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	UGA2	P38067	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CEM1	P39525	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YJL045W	P47052	634 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	SPC105	P53148	917 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MIH1	P23748	554 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GYP7	P48365	746 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GUP2	Q08929	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YKL222C	P35995	705 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YKE2	P52553	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MTC3	P53077	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	SNF5	P18480	905 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NNK1	P36003	928 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HXT16	P47185	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MDM38	Q08179	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NIC96	P34077	839 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	MDJ1	P35191	511 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	BI4	P03879	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	PTP2	P29461	750 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	ALG14	P38242	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	GIC1	P38785	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	ERP2	P39704	215 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	ECM9	Q02202	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YSC84	P32793	468 aa		4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YER158C	P40095	573 aa		4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	YIR007W	P40566	764 aa		4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NIT3	P49954	291 aa		4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	NHX1	Q04121	633 aa		4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
RTS1	YOR014W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	SRT1	Q03175	343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	PHM6	Q05637	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	RMP1	Q12530	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	KCC4	P25389	1037 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	GPT2	P36148	743 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	BIT2	P38346	545 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTS1	YOR014W	YGR153W	P48238	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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