RNA–Protein interactions for RNA: YMR163C

INP2, Transcript of Peroxisome-specific receptor important for peroxisome inheritance, yeast

Gene INP2, Length 2,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP2	YMR163C	MET12	P46151	657 aa		2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PPH3	P32345	308 aa		2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	AFR1	P33304	620 aa		2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PLB1	P39105	664 aa		2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PFD1	P46988	109 aa		2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	HIS5	P07172	385 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	SPE1	P08432	466 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	ERT1	P38140	529 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	GYP7	P48365	746 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YPR196W	Q06595	470 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	HSF1	P10961	833 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YRO2	P38079	344 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	CCC2	P38995	1004 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YER158C	P40095	573 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	CHA4	P43634	648 aa		2.62	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	ADE8	P04161	214 aa		2.61	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	STE11	P23561	717 aa		2.61	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PHO23	P50947	330 aa		2.61	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	FMP25	Q08023	583 aa		2.61	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	HCM1	P25364	564 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YBR284W	P38150	797 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	SIT1	P39980	628 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	ALR2	P43553	858 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	UBX5	Q06682	500 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	RAD4	P14736	754 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YKE2	P52553	114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	EAF1	Q06337	982 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	YPR071W	Q12346	211 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	KCS1	Q12494	1050 aa		2.6	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	RPC82	P32349	654 aa		2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NCS6	P53088	359 aa		2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	TPO2	P53283	614 aa		2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NTO1	Q12311	748 aa		2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	NPC2	Q12408	173 aa		2.59	□□□□□ -1.99
INP2	YMR163C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	DCG1	P32460	244 aa		2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	TRM2	P33753	639 aa		2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	TOK1	P40310	691 aa		2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	EXG2	P52911	562 aa		2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	SPO75	Q07798	868 aa		2.59	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	ARE1	P25628	610 aa		2.58	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	RPD3	P32561	433 aa		2.58	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	LCD1	Q04377	747 aa		2.58	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	UPC2	Q12151	913 aa		2.58	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	HBN1	Q96VH4	193 aa		2.58	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	REC104	P33323	182 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	STE13	P33894	931 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	ATG19	P35193	415 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	TIM54	P47045	478 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	ERP6	P53198	216 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	SUN4	P53616	420 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	OSH2	Q12451	1283 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	TOP3	P13099	656 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	KAR4	P25583	335 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	CDC11	P32458	415 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	PUS9	Q12069	462 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	LAS17	Q12446	633 aa		2.57	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	STE14	P32584	239 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	PET10	P36139	283 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	MSS4	P38994	779 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	CEP3	P40969	608 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	IOC3	P43596	787 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	MSE1	P48525	536 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	YGR125W	P53273	1036 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
INP2	YMR163C	CIT1	P00890	479 aa		2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
INP2	YMR163C	SED4	P25365	1065 aa		2.56	□□□□□ -2

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